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绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨杨 1 ; 余乾 1 ; 刘昱成 1 ; 杨华 1 ; 赵卓 1 ; 王立民 1 ; 周平 1 ; 杨庆勇 1 ; 代蓉 1 ;

作者机构: 1.新疆农垦科学院

关键词: 绵羊;MYL;基因家族;生物信息学分析;基因表达

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2024 年 004 期

页码: 1551-1564

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解肌球蛋白轻链(myosin light chain,MYL)基因家族在绵羊中的分子进化关系及表达变化,本研究利用生物信息学方法对绵羊MYL基因家族进行鉴定和系统分析。各选取了3只军垦白肉羊、新疆细毛羊和湖羊成年公羊各组织样品,采用qRT-PCR方法验证家族成员MYL1、MYL6B和MYLPF基因的表达情况。结果显示,12个MYL基因分布在9条染色体上,编码由147~211氨基酸组成的亲水性蛋白质,无信号肽和跨膜结构域,二级结构以α-螺旋为主。根据基因结构、保守结构域和基序分布等特征,可以将这些基因家族成员分为3个组。共线性分析结果表明,MYL2和MYL10、MYL2和MYLPF存在片段复制,且这些片段受到较强的选择压力。蛋白互作网络显示MYH10与绵羊MYL家族成员均存在互作关系。MYLs的组织表达模式差异较大,其中MYL1、MYL2、MYL6B和MYLPF在骨骼肌组织中高水平表达。基因克隆测序结果显示,扩增得到目的基因的CDS全长,qRT-PCR结果表明,MYL1、MYL6B和MYLPF在军垦白肉羊肌肉组织中的表达水平显著高于其他组织(P<0.000 1),并且在军垦白肉羊骨骼肌中的表达水平显著高于湖羊和细毛羊(P<0.000 1)。以上结果为深入研究绵羊MYL基因家族的功能以及优化绵羊肉用性能提供了线索。

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