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Magnetospira sp.QH-2 MamK蛋白的结构和系统进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 滕兆洁 1 ; 张文燕 1 ; 刘佳 1 ; 董逸 1 ; 陈一然 1 ; 潘红苗 1 ; 杜海舰 1 ; 王明玲 1 ; 徐丛 1 ; 肖天 1 ;

作者机构: 1.中国科学院海洋研究所

关键词: MamK;系统进化;16S rRNA基因;磁小体岛;结构

期刊名称: 海洋科学

ISSN: 1000-3096

年卷期: 2016 年 07 期

页码: 1-7

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: Magnetospira sp.QH-2是一株分离自黄海潮间带的海洋趋磁螺菌,该菌磁小体排列不整齐,并且磁小体链内某些区域排列疏松,推测与其磁小体岛上的mam K编码的Mam K蛋白相关。mam K开放阅读框大小为1086 bp,编码361个氨基酸,Mam K蛋白属于NBD_sugar-kinase_HSP70_actin超家族,为非跨膜蛋白;此外,还利用生物信息学工具预测Mam K蛋白二级和三级结构。系统进化分析显示Mam K蛋白的系统进化和16S r RNA基因的系统进化有一定差异,推测磁小体岛的获得可能与菌种的进化是独立的两个过程;淡水与海水中的趋磁螺菌虽然形态相似,但系统进化地位有一定差异,可能是两者不同生境下适应性演化的结果。

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