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橡胶灵芝菌(Ganoderma pseudoferreum)DNA条形码检测筛选(英文)

文献类型： 中文期刊

作者： 蔡海滨 1 ; 涂敏 1 ; 孙爱花 1 ; 程汉 1 ; 安泽伟 1 ; 胡彦师 1 ; 李维国 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/国家橡胶树育种中心

关键词： 橡胶灵芝菌;鉴定;DNA条形码;ITS

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2018 年 011 期

页码： 2225-2234

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选用10对DNA条形码标准序列ITS、COI、nrDNA-LSU、nrDNA-SSU和trnL DNA对海南和云南红根病区分离的21个橡胶灵芝菌进行检测.除COI和trnLDNA外,其他8对引物均扩增得到PCR产物,产物大小范围为268~1355bp,种内相似度为98.05%~99.54%.分别将扩增得到的序列与GenBank公布上的Ganoderma属和常见真菌属序列,共77个ITS、74个nrDNA-LSU和74个nrDNA-SSU序列进行系统进化树构建与分析.结果表明:nrDNA-LSU序列和nrDNA-SSU序列种间差异较小,不能准确区分Ganoderma属及其他属;5对ITS序列均能区分Ganoderma属,但仅ITS1/ITS4序列能将Ganoderma属下16个种归入不同分支.ITS1/ITS4序列表现出适宜的种内与种间差异,适宜作为G. pseudoferreum的DNA条形码.

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[1]橡胶灵芝菌(Ganoderma pseudoferreum)DNA条形码检测筛选（英文）. 蔡海滨,涂敏,孙爱花,程汉,安泽伟,胡彦师,李维国. 2018

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