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白芷种质遗传多样性与群体结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 许兰杰1,2 1 ; 安素妨1,2 2 ; 余永亮1,2 2 ; 董薇1,2 2 ; 梁慧珍1,2 2 ; 谭政委1,2 2 ; 杨青1,2 2 ; 杨红旗1,2 2 ; 吴晓慧1,2 2 ;

作者机构: 1.1.河南省农业科学院中药材研究所

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关键词: 白芷;种质;SCoT标记;遗传多样性;群体结构;聚类分析

期刊名称: 河南农业科学

ISSN: 1004-3268

年卷期: 2025 年 54 卷 007 期

页码: 64-71

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探明白芷亲本中材料的遗传多样性和群体结构特点,提高白芷种质的利用效率,选用28个目标起始密码子多态性(Start codon targeted polymorphism,SCoT)标记对来自5个白芷居群的78份种质进行PCR扩增,采用POPGENE 1.32、GenALEx6.502等软件研究其遗传多样性和群体结构。结果表明,28个SCoT标记共扩增出192个条带,其中多态性条带159个,平均每个标记的扩增条带数和多态性条带数分别是7、6个;SCoT标记的平均多态性信息含量值(PIC)、平均Shannon’s多样性指数(I)和平均Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.800、0.350、0.240,表现出较高的遗传多样性。5个白芷居群每个位点平均等位基因数(Na)、平均有效等位基因数(Ne)、平均I和平均期望杂合度(He)分别为1.514、1.293、0.265、0.174,以禹白芷居群的Na、Ne、I、He最高。5个白芷居群遗传分化系数和基因流分别为0.135、3.195,94%遗传变异来自居群内,较大的基因流减少了居群间遗传差异。基于居群间的遗传相似系数(GS)在0.96处将5个白芷居群聚为三大类,其中禹白芷、杭白芷和川白芷居群被聚为一类;基于白芷种质的GS在0.765处将其聚为三大类,分别包含73、3、2份白芷种质。综上,5个白芷居群遗传多样性水平较低,种质间的亲缘关系较近,应加强白芷种质资源创制工作。

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