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蝴蝶兰EST资源的SSR信息分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李冬梅 1 ; 吕复兵 1 ; 朱根发 1 ; 洪彦彬 2 ; 陈小平 2 ; 梁炫强 2 ; 操君喜 1 ; 孙映波 1 ;

作者机构: 1.广东省农科院花卉研究所/广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室

2.广东省农科院作物研究所

关键词: 蝴蝶兰;EST;SSR信息

期刊名称: 广东农业科学

ISSN: 1004-874X

年卷期: 2011 年 38 卷 03 期

页码: 117-120

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对5 472条蝴蝶兰无冗余EST序列进行了SSR搜索,共检索出376条EST含有419个SSR位点,平均每7.4 kb EST序列出现1个SSR。共有60种SSR的重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占SSR总数的67.1%和30.3%;AG/CT在SSR基元中出现频率最高(46.1%),AT/AT次之(18.6%)。根据搜索结果设计了100对蝴蝶兰EST-SSR引物,并随机合成了20对引物。以2个蝴蝶兰品种的DNA为模板,对引物进行了筛选和评价,有16对引物扩增出稳定且清晰的目标产物,其中12对引物扩增的产物存在多态性。

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