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艾草SSR分子标记开发及利用研究

文献类型: 中文期刊

作者: 阴志刚 1 ; 陈培育 1 ; 周晓静 1 ; 曹双 1 ; 鞠乐 1 ; 梁慧珍 2 ;

作者机构: 1.南阳市科学院

2.河南省农业科学院中药材研究所

关键词: 艾草;转录组;SSR;指纹图谱

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2025 年 44 卷 009 期

页码: 56-63

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为开发用于构建种质资源指纹图谱及品种鉴定的艾草特异性SSR分子标记,基于前期艾草转录组测序数据,采用MicroSAtellite软件进行SSR位点发掘,Primer 3.0批量引物设计,PCR扩增后利用毛细管电泳测序分析.结果表明,检测出21 980个SSR位点,分布于20 069条转录本中,批量设计出15 961对SSR引物,随机挑选的30对引物中筛选出10对多态性高的引物,进一步筛选出用于构建包含25份艾草种质资源指纹图谱、鉴定四大名艾及南阳艾系列品种的特异性SSR引物组合.艾草转录组SSR分子标记位点丰富,开发艾草特异性SSR分子标记,能够为艾草遗传多样性分析、指纹图谱构建、分子辅助育种、品种鉴定等研究提供参考.

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