文献类型： 中文期刊
作者： 李胜杰 1 ; 白俊杰 2 ; 赵荦 2 ; 朱冰 2 ; 朱新平 3 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院
2.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院
3.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;
关键词： 大口黑鲈;转录组;SNP;遗传多样性;关联分析
期刊名称： 海洋渔业
ISSN： 1004-2490
年卷期： 2018 年 01 期
页码： 38-46
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为探讨EST-SNP标记的有效性及其与大口黑鲈(Micropterus salmoides)生长性状间的相关性,本研究采用RNA-seq技术进行大口黑鲈生长快个体和生长慢个体肌肉组织的转录组分析,分别检测到15 273和17 376个EST-SNP标记。采用Sna Pshot技术对其中75个EST-SNP标记在大口黑鲈生长性状极端群体中的EST-SNP进行多态性检测,结果显示有37个EST-SNP标记具有多态性,准确性为49.3%。进一步采用一般线性模型分析37个EST-SNP标记与大口黑鲈生长性状的相关性,结果表明:CL1452.Contig9_All-847位点的CC基因型在体质量、全长和尾柄长3个性状的均值都显著高于TT基因型(P<0.05),CC型在体高、头长中的均值都比CT和TT型的均值高,但差异未达到显著水平(P>0.05),其它位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异(P>0.05)。其中10个EST-SNP标记在大口黑鲈"优鲈1号"群体中的平均观测杂合度(Ho)和平均多态(PIC)信息含量分别为0.459和0.356,表明大口黑鲈"优鲈1号"群体具有较丰富的遗传多样性。CL1452.Contig9_All-847位点与生长性状显著相关(P<0.05),可用于大口黑鲈分子标记辅助育种。
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