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大豆β-1,3-葡聚糖酶(GmBG1)及其同源蛋白的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张丽 1 ; 魏崃 1 ; 唐晓飞 1 ; 王伟威 1 ; 于志远 1 ; 刘丽君 1 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院大豆研究所

关键词： β-1,3-葡聚糖酶;系统进化分析;基因表达分析;生物信息学

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 1035-1042

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： β-1,3-葡聚糖酶是普遍存在于多种生物中的一类多基因家族蛋白,属于PR-2家族蛋白,与植物的生长发育及防御体系有关。克隆和鉴定大豆β-1,3-葡聚糖酶家族基因对大豆抗逆育种具有重要意义。本研究应用生物信息学的方法共筛选获得45个β-1,3-葡聚糖酶基因。结果表明,GmBG1具有典型的β-1,3-葡聚糖酶家族的保守结构域及氨基酸位点,含有347个氨基酸,pI值为8.71,二级结构以ɑ螺旋为主,且N端信号肽为α螺旋结构,属于碱性蛋白。大豆β-1,3-葡聚糖酶家族基因主要在根和花中表达;实时荧光定量PCR分析表明,在腐霉菌P.ultimum的侵染下GmBG1基因在不同的抗病品种中的表达量存在差异;GmBG1基因在抗病品种中24 h时表达水平最高,而感病品种的该表达量无明显变化;此外抗病品种的该表达量明显高于感病品种。

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