您好,欢迎访问江苏省农业科学院 机构知识库!

基于流式细胞术和K-mer方法测定6种槭属植物基因组大小

文献类型: 中文期刊

作者: 马秋月 1 ; 王玉虓 1 ; 李倩中 1 ; 李淑顺 1 ; 闻婧 1 ; 朱璐 1 ; 颜坤元 1 ; 杜一鸣 1 ; 解志军 1 ; 李淑娴 1 ; 欧阳芳群 1 ; 鲁成代 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院休闲农业研究所;南京林业大学林学院南方现代林业协同创新中心;襄阳市林业科学技术推广站;北京市植物园;天水市五小叶植物保护研究所

关键词: 械属;基因组大小;流式细胞术;K-mer分析

期刊名称: 南京林业大学学报(自然科学版)

ISSN: 1000-2006

年卷期: 2023 年 47 卷 001 期

页码: 163-170

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]械属植物种类繁多,具有观赏、油用、药用等重要价值,开发应用前景广阔.基于流式细胞术和K-mer分析方法,首次进行6种槭树基因组大小测定,为械属植物分子生物学、细胞学研究提供重要理论参考.[方法]以6种械树嫩叶为材料,WPB为细胞核解离液,大豆(Glycine max'Polanka')和玉米(Zea mays CE-777)为内标,利用流式细胞检测技术和K-mer分析法估测6种槭树的基因组大小.[结果]基于流式细胞术测定建始槭(Acer henryi)、三角枫(A.buergerianum)、秀丽槭(A..elegantulum)、血皮槭(A.griseum)、五小叶槭(A.pentaphyl-lum)和青楷槭(A.tegmentosum)的基因组大小分别为(691.12±8.69)、(863.90±8.69)、(896.50±4.35)、(893.24±8.69)、(766.10±8.69)和(1 154.04±13.04)Mb;以 K-mer 分析法估测的基因组大小分别为 561.72、743.00、777.87、771.51、650.64和1 103.46 Mb;杂合率分别为1.00%、1.24%、1.31%、1.08%、0.28%、0.81%.K-mer分析法估测的基因组大小略小于流式细胞术预测结果.[结论]本研究的结果可丰富槭属植物基因信息库,也可为该属植物基因组学、分子细胞遗传学等研究奠定重要基础.

  • 相关文献

[1]基于流式细胞术和K-mer分析的银缕梅属(Parrotia C.A.Mey.)植物基因组大小测定. 张云燕,安宇,林峰,马秋月,周翔宇,金亮,李朋富,王中生. 2021

[2]基于流式细胞术和基因组Survey的绣球基因组大小及特征分析. 陈双双,齐香玉,冯景,王华娣,邓衍明. 2021

[3]基于流式细胞术的旱柳染色体倍性与基因组大小测定. 张健,王莹,马祥建,谈峰,李敏,李玉娟. 2018

[4]25份甘薯登记品种基因组大小测定. 苏一钧,王珧,戴习彬,赵路宽,张安,曹清河. 2019

[5]3种瓣型茉莉基因组大小测定与比较. 齐香玉,陈双双,冯景,王华娣,邓衍明. 2020

[6]6种野生草莓基因组大小估算. 陈丙义,李金凤,霍恒志,万春雁,章镇. 2015

[7]甘薯近缘种人工合成四倍体的倍性鉴定和减数分裂行为观察. 邓逸桐,王珧,张安,孙建英,戴习彬,孙健,唐君,曹清河. 2020

[8]甘薯近缘种Ipomoea cordatotriloba基因组大小测定及高通量调查测序. 王珧,邓逸桐,戴习彬,张安,曹清河,陈艳丽. 2020

[9]实时定量PCR法预测禾谷丝核菌Rhizoctonia cerealis基因组大小. 张春燕,李伟,孙海燕,邓渊钰,张爱香. 2014

[10]甘薯属耐盐植物马鞍藤基因组大小及特征分析. 霍恺森,赵冬兰,陈艳丽,周志林,王珧,唐君,朱国鹏,曹清河. 2019

[11]芋[Colocasiaesculenta(L.) Schott]的倍性水平及基因组特征解析. 殷剑美,王立,蒋璐,韩晓勇,郭文琦,李春宏,张培通. 2019

[12]利用流式细胞仪检测草莓倍性方法的优化. 于红梅,王静,赵密珍,孟宪凤. 2012

作者其他论文 更多>>