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玉米VOZ基因家族的鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 时丕彪 1 ; 胡凤琴 2 ; 蒋润枝 1 ; 吕远大 2 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院盐城市新洋农业试验站

2.江苏省农业科学院卓越创新中心

关键词： 玉米;VOZ基因家族;转录因子;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2021 年 023 期

页码： 7666-7672

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 维管植物锌指蛋白（vascular plant one-zinc finger protein, VOZ）基因家族是植物特异性的转录因子家族,参与调控植物多种生物学过程。为探究玉米VOZ基因家族的生物学特性,本研究以玉米高质量基因组为参考,利用生物信息学方法对玉米VOZ基因家族进行全基因组鉴定,并分析其理化性质、基因结构、保守结构域、系统进化关系和组织表达。结果表明,玉米中有6个ZmVOZ基因,且不均匀地分布在5条染色体上;编码蛋白的长度在309～652 aa之间,分子量为35.20～72.80 kD,多为酸性蛋白;基因结构差异较大,每个成员含2～8个外显子和1～7个内含子。ZmVOZ转录因子都具有一个高度保守的VOZ结构域,二级结构元件多为无规卷曲。系统进化树分析表明,玉米、高粱和水稻的VOZ转录因子亲缘关系最近,与拟南芥和棉花的同源性较低。ZmVOZ基因在玉米不同组织中的表达量存在显著差异,除GRMZM2G062651和GRMZM2G094081在各组织中均不表达外,其他基因可能与玉米果皮发育密切相关。本研究为进一步研究ZmVOZ基因的功能提供了理论依据。

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