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大口黑鲈微卫星多重PCR体系及3个群体的遗传分析

文献类型: 中文期刊

作者: 傅建军 1 ; 龚雅婷 2 ; 朱文彬 1 ; 强俊 1 ; 张林兵 3 ; 王兰梅 1 ; 罗明坤 1 ; 董在杰 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室

2.南京农业大学无锡渔业学院

3.安徽张林渔业有限公司

关键词: 微卫星;多重PCR;遗传分析;大口黑鲈

期刊名称: 水生生物学报

ISSN: 1000-3207

年卷期: 2023 年 47 卷 009 期

页码: 1514-1522

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为开展大口黑鲈(Micropterus salmoides)种质评估和遗传分析提供便捷的研究手段,试验筛选了扩增效果好、具有多态性的18个微卫星位点,构建了6组3重PCR体系.随后将多重PCR体系应用于大口黑鲈3个群体(美国群体USA、"优鲈1号"YLO和杂交子代HYB)的遗传分析.结果显示,各位点的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态性信息含量(PIC)分别介于3-14、1.622-5.841、0.333-0.806、0.385-0.833和0.361-0.810,其均值分别为7.722、3.056、0.577、0.626和0.579.剔除2个偏离Hardy-Weinberg平衡位点的分析显示,YLO的遗传多样性水平最低,HYB的平均观测杂合度最高(Ho= 0.743),其余多态性指标均在USA中呈现最高值.USA与YLO间的Nei's遗传距离最远(0.362),HYB与USA和YLO间的Nei's遗传距离分别为0.112和0.179.两两群体间均存在极显著的遗传分化(P<0.01),其中USA与YLO间遗传分化水平最高(FST=0.209).基于等位基因频率的遗传结构分析结果显示,USA和YLO具有相对独立的遗传结构,而HYB呈现出不同的遗传来源.主成分判别分析的散点图显示,不同群体来源的个体能获得较有效区分,HYB分布介于USA和YLO的区域之间.研究表明,试验构建的微卫星多重PCR体系,涉及位点具有较高多态性,并能有效应用于大口黑鲈的群体遗传分析,可为其遗传育种研究提供技术支持.

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