文献类型： 中文期刊
作者： 贾庆麟 1 ; 张瑞花 2 ; 王文强 1 ; 丁西朋 1 ; 刘国道 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
2.海南大学农学院中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
关键词： 柱花草;EST-SSR;有效性;多态性
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2016 年 05 期
页码： 1195-1202
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为获得有效的分子标记,并应用于柱花草的遗传学研究中。本研究基于柱花草转录组测序获得的36 558条EST序列,利用MISA和PRIMER 3.0软件进行EST-SSR标记开发,对所开发标记进行特征分析,最终获得柱花草新EST-SSR标记2 008对,然后随机合成523对SSR标记并对其有效性及应用效果进行评价。其中主要重复类型是二核苷酸、三核苷酸,分别占30.50%和50.33%,在二、三核苷酸中的优势重复类型分别为AG/CT,AAG/CTT。在随机合成的523对引物中,472对引物都有扩增产物,扩增效率达到90.25%,其中有多态性的引物179对,占可扩增引物的37.92%,具有较高的多态性。利用新EST-SSR标记分析表明55份F_1单株均为真杂种,并能对F_2群体单株进行基因型鉴定。本研究开发的新EST-SSR标记将为柱花草遗传图谱的构建、基因克隆、指纹图谱构建奠定基础。
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