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甘薯中NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 林巧玲 1 ; 曾会才 2 ;

作者机构： 1.广东海洋大学农学院

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 甘薯;NBS-LRR同源序列;抗病基因

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2007 年 16 卷 02 期

页码： 65-69

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据已知的NBS-LRR类抗病基因蛋白质的保守序列设计简并引物,用以扩增甘薯基因组中的抗病基因同源序列,获得一条大小约500 bp的扩增片段,克隆测序后得到20个NBS-LRR类抗病基因同源片段RGAS。其推导的氨基酸序列均具有P-loop、Kinase-2a和Kinase-3a及GLPL区等几个保守区,并且可分为TIR-NBS-LRR和non-TIR-NBS-LRR两个亚类。其中10个TIR亚类RGAS与已克隆的N、L6、M等抗病基因相应区段的氨基酸序列的同源性为21%-44%,而10个non-TIR亚类RGAS与已克隆的Prf、RPM1、RPS2等抗病基因相应区段的氨基酸序列的同源性为15%-46%。这些抗病基因同源片段(RGA)可做为分子标记筛选甘薯的抗病候选基因。

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