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高温胁迫下陆地棉转录组差异性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王辉 1 ; 董永梅 1 ; 郭伟锋 1 ; 曹新川 1 ; 郭金成 1 ; 谢宗铭 1 ; 何良荣 1 ;

作者机构： 1.塔里木大学农学院;新疆农垦科学院棉花研究所;作物种质创新与基因资源利用兵团重点实验室

关键词： RNA-Seq;陆地棉;高温胁迫;差异表达;代谢通路

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2023 年 60 卷 011 期

页码： 2618-2626

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]研究陆地棉高温胁迫下关键基因的响应,比较基因表达差异,为揭示陆地棉高温胁迫响应的分子机制提供参考.[方法]利用RNA-Seq对正常温度(26℃)和高温胁迫(42℃)的陆地棉品系YZ1进行转录组测序和数据分析.[结果]在WN4/WH4,WN12/WH12,WN24/WH24,WN48/WH48共鉴定出383个共有上调基因和234个共有下调基因.将差异基因按GO功能分类,主要富集到上调差异基因和下调差异基因20个类别;差异基因显著富集到类黄酮生物合成途径、苯丙烷代谢、昼夜节律-植物、内质网加工等通路;鉴定出39个转录因子,主要是WRKY和MYB两大家族;Gohir.A08G104100是高温胁迫主要的基因,对植物的耐热性至关重要,Gohir.D08G033300是质体类异戊二烯生物合成的限制酶,对叶绿体发育至关重要.2个差异基因在整个时期表达量差异倍数较为显著.[结论]高温胁迫和正常温度下在不同时间段,陆地棉的基因转录表达差异.

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