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香蕉冷胁迫相关MicroRNA差异表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王静毅 1 ; 刘菊华 1 ; 金志强 1 ; 徐碧玉 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;中国热带农业科学院海口实验站/海南省香蕉遗传改良重点实验室

关键词： 香蕉;MicroRNA;实时荧光定量RT-PCR;表达分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2019 年 05 期

页码： 49-57

摘要： 研究香蕉miRNA在冷胁迫处理下的动态表达,初步探索miRNA在香蕉冷胁迫过程中的可能作用。利用茎环引物实时荧光RT-PCR(stem-loop qRT-PCR)策略,检测冷胁迫响应miRNA在5℃冷胁迫处理不同时间点香蕉幼苗叶片中的表达模式。结果表明,在检测的15个香蕉miRNAs中,不同的miRNA在同一冷胁迫时间下的表达量存在很大差异。根据其表达模式,可将15个miRNA分成4组。组1和组2中的12个miRNA(miR159e、miR159f、miR160-3p、miR397a、miR399j、miR164e、miR444a、miR408、miR5179、miR530、miR535和miR5538),在5℃冷胁迫处理下表达量总体为上调,其在胁迫过程中的平均表达水平高于对照CK(0 h),说明冷胁迫诱导此类miRNA的表达。第3组包括miR156l、miR162a和miR166a,其在5℃冷胁迫处理各时间点的表达量均低于对照,为下调表达,说明冷胁迫抑制此类miRNA的表达。第4组仅含1个miRNA,即miR156a,除在冷胁迫处理12 h表达量明显上调外,其余时间点均下调表达。对这些miRNAs作用的靶基因进行预测和分析发现,它们主要参与植物的新陈代谢、信号传导和生长发育过程等。这为进一步验证与低温胁迫相关的目的miRNA的功能提供理论依据。

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