文献类型： 中文期刊
作者： 高嵩 1 ; 吕庆雪 1 ; 何欢 1 ; 张建新 1 ; 张志军 1 ; 宋广树 1 ; 刘伟 1 ;
作者机构： 1.吉林省农业科学院;吉林省吉东种业有限责任公司
关键词： ZmUdt1基因;玉米;生物信息学分析
期刊名称： 华北农学报
ISSN： 1000-7091
年卷期： 2018 年 01 期
页码： 52-59
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了研究玉米中绒毡层发育调控基因Udt1的功能与作用,进行生物信息学分析,通过利用Udt1基因培育雄性不育的玉米新品种,来提高杂交种纯度和种质质量并缩短育种年限。该试验采用已知的水稻OsUdt1基因(AY953870.1)为参考序列,使用同源克隆的方式在玉米基因组中得到同源性最高的基因BT068494.1(GenBank),并利用生物信息学方法预测该基因的各级结构以及生物学功能等,同时使用MEGA 7.0程序软件构建分子系统进化树。ZmUdt1基因位于玉米的第2条染色体上,ZmUdt1蛋白由219个氨基酸构成,蛋白的相对分子量为24.48 ku,等电点为5.35,属于亲水蛋白;主要由α-螺旋与无规则卷曲构成二级结构,其三级结构与水稻OsUdt1蛋白的三级结构基本一致,属于HLH超级家族,没有信号肽以及跨膜结构;亚细胞定位预测该蛋白位于细胞核中的可能性较大;通过预测,该蛋白具有翻译、复制与转录、转录调控信号转导等功能,具有17个磷酸化修饰位点,而是否具有其他功能尚没有确定。系统进化树表明,玉米与水稻、高粱等物种遗传距离最近,且与拟南芥的DYT1蛋白也有一定的遗传相关性。通过预测和比较,ZmUdt1和OsUdt1蛋白在结构和功能上具有极高的相似性。研究结果可为进一步研究ZmUdt1蛋白的功能与作用,以及创新玉米的雄性不育系提供理论依据。
- 相关文献
[1]玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析. 王文丽,穆春华,张发军,刘霞,冷冰莹,姚国旗,闫振伟,刘巍,王昀,张恩盈. 2023
[2]草原红牛Acot2基因克隆及其在各组织中的表达差异研究. 刘理想,高一,吕阳,薛佳佳,胡忠昌,张国梁. 2019
[3]小尾寒羊ACAA1基因CDS克隆及组织表达谱分析. 王延莉,梁祎凡,肖成,金花子,曹阳,金海国. 2019
[4]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT3J的克隆及生物信息学分析. 李楠,朱旭,柳青,郭嘉,孙传波,李传龙,贺红利,贺红霞. 2021
[5]草原红牛Bcl2L13的CDS克隆及其在不同组织的表达规律研究. 刘理想,高一,秦立红,吕阳,薛佳佳,吴健,胡忠昌,张国梁. 2020
[6]大肠杆菌Top10Na~+/H~+反向运输体A基因的克隆及生物信息学分析. 麻鹏达,周磊,李毅丹,谭化,刘艳芝. 2008
[7]大肠杆菌Top10甘露醇-1-磷酸脱氢酶基因克隆及生物信息学分析. 麻鹏达,张晓英,李海云,马瑞. 2008
[8]绵羊角蛋白关联蛋白2基因的克隆表达与生物信息学分析. 刘晓军,张立春,韩林凯,楚熹橦,崔成都,鲁承,金海国,孙福亮. 2018
[9]中国草原红牛PDK4基因克隆及其组织表达差异性研究. 马彦茹,于永生,肖成,曹阳,秦立红,赵玉民,吴健. 2022
[10]草原红牛肝配蛋白A5基因克隆及其在不同组织中的表达研究. 薛佳佳,秦立红,曹阳,高一,刘理想,李旭,肖成,王晶,张国梁. 2021
[11]16﹪克·福·醇种衣剂对玉米苗期病虫害和丝黑穗病防治效果研究. ^A晋齐鸣^B1%^A宋淑云^B2%^A李红^B3%^A王立新^B4. 2001
[12]16﹪克·福·醇种衣剂对玉米苗期病虫害和丝黑穗病防治效果研究. ^A晋齐鸣^B1%^A宋淑云^B2%^A李红^B3%^A王立新^B4. 2001
[13]从区域试验看吉林省玉米育种. 徐航. 2000
[14]吉林省西部半干旱区玉米节水栽培技术现状与研究方向. 边少锋,谭国波,张丽华,赵洪祥,方向前,孟祥盟,闫伟平. 2008
[15]玉米宽窄行留茬深松的土壤理化性质变化. LIU Wu-ren,刘武仁,ZHENG Jin-yu,郑金玉,LUO Y,罗洋. 2008
[16]不同肥力土壤中分解几丁质微生物代谢产物对玉米的促生效果研究. 金荣德,吴海燕,闫海洋,孙卉,范作伟. 2014
[17]吉林中部黑土区玉米高产栽培土壤培肥技术研究. Ren Jun,任军,Guo Jin-Rui,郭金瑞,Yan Xiao-Gong,闫孝贡,Liu Jian-Zhao. 2012
[18]玉米宽窄行种植对土壤生态环境影响试验研究. 刘武仁,郑金玉,冯艳春,刘凤成,邱贵春,罗洋. 2004
[19]施硅对玉米水分生理特性的影响. 任军,郭金瑞,郐仲智,袁震霖. 2001
[20]玉米条带深松高茬覆盖条件下土壤水分变化规律研究. 刘武仁,郑金玉,冯艳春,刘凤成,罗洋,李伟堂. 2006
作者其他论文 更多>>
-
东北地区农村能源生态农宅改造模式分析-以太阳能+空气能+节能建筑改造为例
作者：麻明可;吕庆雪;关法春
关键词：太阳能;空气能;节能建筑;综合效益
-
应用低密度SNP芯片解析玉米遗传多样性
作者：高嵩;张楠;何欢;郑淑波;赵桐;周小辉;代秀云;黄威;王薪淇
关键词：玉米;SNP;类群划分;聚类分析
-
优化玉米单倍体育种技术流程的探讨
作者：周旭东;岳尧海;王敏;张建新;马英杰;周德龙;张志军;刘文国
关键词：玉米;单倍体育种技术;优化;常规育种技术
-
吉林省秸秆资源现状与能源化利用技术分析
作者：麻明可;娄鲲鹏;史俊菲;吕庆雪;汤继超;胡光;焦帅
关键词：吉林省;秸秆;资源现状;能源化;能源化技术
-
国外玉米杂交种在我国育种中的应用
作者：代秀云;王薪淇;吴凤新;周小辉;何欢;岳尧海;高嵩;孟令聪;侯国生;焦仁海
关键词：玉米;国外杂交种;育种;应用
-
利用CRISPR-Cas9技术编辑ZmSh2基因创制超甜玉米新种质
作者：吕庆雪;汤继超;周德龙;周迎鑫;吴广宇;孙蕾;宋广树
关键词：玉米;CRISPR-Cas9技术;ZmSh2基因;遗传转化
-
玉米子粒主要营养成分合成调控研究进展
作者：周迎鑫;李玥峤;吕庆雪;路运才;宋广树
关键词：玉米;淀粉;蛋白质;脂肪
