文献类型： 中文期刊

作者： 田雨苏 ¹ ; 孙远东 ¹ ; 欧密 ² ; 刘雨芳 ¹ ; 崔小娟 ¹ ; 周定港 ¹ ; 车文安 ¹ ; 陈昆慈 ² ;

作者机构： 1.湖南科技大学生命科学学院

2.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室

关键词： 红鲫胚胎;壬基酚;转录组测序;荧光定量PCR

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2020 年 010 期

页码： 1619-1636

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 壬基酚(nonylphenol,NP)是广泛存在于水体中的环境内分泌干扰物,对生物体的生长发育造成影响.为了探究壬基酚致红鲫发育畸形的机制,本研究以红鲫为研究对象,采用Illumina HiSep 2500对正常神经胚期胚胎(NC)、正常21体节期胚胎(SC)和暴露5μmol/L NP中发育畸形的神经胚期胚胎(NNP)、畸形21体节期胚胎(SNP)进行转录组测序(RNAseq),并结合实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达基因(differential expression gene,DEG).RNA-seq共得到89 166条高质量unigenes,其中30 319条unigenes获得注释结果.NC、SC、NNP和SNP两两比较分析发现,NC/NNP中DEGs 153个,SC/SNP中DEGs10个,NC/SC中DEGs 6 121个,NNP/SCP中DEGs 7 270个.KEGG分析发现,上述DEGs多数聚集在细胞过程、环境信息处理和新陈代谢通路上.利用qRT-PCR验证了生长、发育、细胞骨架及心血管循环相关的25个DEGs,它们的表达变化在qRT-PCR和RNA-seq中结果一致,一方面说明了RNA-seq结果可靠,另一方面初步挖掘出NP胁迫致红鲫胚胎发育畸形的候选基因,为后续深入探讨NP致畸的分子机制研究提供前期数据.