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大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邹智 1 ; 安锋 1 ; 杨礼富 1 ; 王真辉 1 ; 袁坤 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室

关键词： 大戟科植物;全基因组;Lhcb基因家族;鉴定;分类;进化分析

期刊名称： 中南林业科技大学学报

ISSN： 1673-923X

年卷期： 2013 年 33 卷 12 期

页码： 46-52

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于已公布的基因组和EST数据,研究对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的Lhcb基因家族进行系统鉴定,并在此基础上分析其基因结构与进化关系。结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有10、10、13和15个Lhcb基因,分属于Lhcb1、Lhcb2、Lhcb3、Lhcb4、Lhcb5、Lhcb6、Lhcb7和Lhcb8等8个亚家族,每个亚家族包含1～4个成员不等,基因的内含子数目在0～5个之间,部分基因还存在可变剪接形式。进化分析显示,Lhcb1、Lhcb4、Lhcb5和Lhcb7亚族早于单细胞的藻类中就已产生,Lhcb3和Lhcb6亚族在光合生物向陆地进化后产生,Lhcb2亚族存在于高等植物中,Lhcb8亚族则为双子叶植物所特有;Lhcb1亚族在所分析的4种大戟科植物中均出现了基因扩增,Lhcb2和Lhcb5亚族在木薯和橡胶树中出现了扩增,而Lhcb3和Lhcb6亚族仅在橡胶树中出现了扩增。

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