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弗氏柠檬酸杆菌噬菌体NM4.3生物学特性及全基因组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈煜裕 1 ; 刘畅 2 ; 魏永谦 1 ; 刘春 1 ; 姜敬哲 2 ;

作者机构: 1.仲恺农业工程学院动物科技学院

2.中国水产科学研究院南海水产研究所/农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室

关键词: 弗氏柠檬酸杆菌;噬菌体;生物学特性;基因组测序及分析;系统发育分析

期刊名称: 南方水产科学

ISSN: 2095-0780

年卷期: 2025 年 21 卷 004 期

页码: 35-43

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)是近年来牛蛙(Rana catesbeiana)养殖中新出现的高致病性病原菌,其多重耐药性增加了防控难度。从牛蛙养殖尾水中分离出1株裂解弗氏柠檬酸杆菌的噬菌体NM4.3,通过全基因组测序、生物学特性和系统发育分析,评估其潜在应用价值。结果显示,NM4.3为圆环dsDNA噬菌体,基因组大小为174 351 bp,GC含量为38.74%,编码310个开放阅读框(ORF),包含病毒粒子结构、宿主裂解及DNA代谢相关功能基因,还额外编码13个tRNA。生物学特性结果表明,NM4.3潜伏期短(10 min),裂解效率高(爆发量76 PFU·细胞-1),在60℃和pH 3~12处理1 h后仍可维持一定活性。基于基因组的核酸序列和保守基因末端酶大亚基(Ter-L)的氨基酸序列分析,鉴定NM4.3属于Straboviridae、Tevenvirinae、Moonvirus,与已知成员的平均核苷酸一致性(ANI)低于95%,定义为该属下的一个新种。基因组注释发现其长尾纤维蛋白存在变异,这可能是影响宿主特异性的因素。

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