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干旱驯化后节水抗旱稻苗期不同发育时间DNA甲基化模式变化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郑小国 1 ; 陈亮 1 ; 楼巧君 1 ; 夏辉 1 ; 李明寿 1 ; 罗利军 1 ;

作者机构： 1.上海市农业生物基因中心

关键词： 干旱驯化;节水抗旱稻;DNA甲基化;甲基化敏感扩增多态性

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2014 年 28 卷 01 期

页码： 32-40

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以一个节水抗旱稻沪旱3号为研究材料,经过连续6代干旱胁迫驯化后,采用甲基化敏感扩增多态性方法在苗期不同发育时间对原始代(G0)和第6代(G6)DNA甲基化变化情况进行分析。结果表明,沪旱3号甲基化位点比例约为34%,其中,全甲基化位点约占84%,半甲基化位点约占16%。在苗期,随着沪旱3号生长发育,甲基化水平下降。不同世代或/和不同发育时间差异甲基化位点占总检测位点的4.0%,其中,大部分仅与发育相关(57.9%),而世代之间无差异。干旱驯化后,G6的DNA甲基化模式发生了改变。G6与G0相比,在3叶期,去甲基化事件占主要部分(59.1%);在4叶期,甲基化事件占主要部分(47.9%)。生长发育涉及全基因组DNA甲基化变化,变化位点主要分布在启动子区域和外显子区域。功能聚类分析表明差异甲基化位点相关基因涉及广泛的功能。

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