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南极利奇菲尔德岛土壤微生物多样性的初步分析

文献类型: 中文期刊

作者: 宋易洋 1 ; 李桂秀 1 ; 赵芯 2 ; 王国良 2 ;

作者机构: 1.烟台大学生命科学学院

2.北京农业生物技术研究中心

关键词: 南极;土壤微生物;宏基因组测序;生物多样性

期刊名称: 烟台大学学报(自然科学与工程版)

ISSN: 1004-8820

年卷期: 2020 年 003 期

页码: 276-282

摘要: 为探索南极土壤微生物的多样性,本研究以对中国第31次南极科学考察采集的利奇菲尔德岛的不同地理位置的3份土壤样本作为研究对象,基于Illumina NovaSeq测序平台对其进行宏基因组高通量测序,经生物信息学分析,结合MetaPhlAn2、GraPhlAn等分析方法将测序数据精确定位至微生物中属或种的水平,鉴定共获得来自8门11纲20目27科35属38种的微生物序列.样本间微生物丰度差异较大,其中S14样本的优势菌属是颗粒菌属(Granulicella); S16样本的优势菌属是罗思河小杆菌属(Rhodanobacter); S22样本的优势菌种是白色念珠菌(Candida albicans).研究结果对南极土壤微生物资源的利用、开发与保护具有重要意义.

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