文献类型： 中文期刊
作者： 郑益平 1 ; 陈坚 1 ; 朱炳耀 1 ;
作者机构： 1.福建省农业科学院生物技术研究所
关键词： 草莓;metacaspase;细胞程序性死亡(PCD);基因组;表达分析
期刊名称： 福建农业学报
ISSN： 1008-0384
年卷期： 2020 年 35 卷 011 期
页码： 1188-1197
收录情况： CSCD
摘要： [目的]精氨酸/赖氨酸特异性半胱氨酸酶(metacaspases,MCs)在植物生长发育的细胞程序性死亡(programmed cell death,PCD)中发挥重要的调控作用,为系统鉴定草莓FaMC基因家族,进行草莓FaMC基因家族全基因组鉴定及表达分析.[方法]通过草莓全基因组数据分析FaMC蛋白的理化性质、结构域、系统发育关系和保守基序,采用qRT-PCR技术对草莓6个组织器官和6个果实发育时期中的FaMC基因进行表达分析.[结果]蛋白序列分析表明,草莓基因组中21个FaMC成员分为3种类型:I型、I*型和II型.系统发育树和保守结构域分析表明:I型FaMC含N端前结构域且包含1个锌指结构;I*型FaMC含N端前结构域,但其中没有锌指结构;II型FaMC不含N端前结构域.基因表达分析发现,FaMC基因在不同组织中存在表达差异性,I型、I*型和II型FaMC基因分别在叶片、根和花中高表达.在果实发育过程中,多数I*型FaMC基因的表达水平呈现出高-低-高的动态变化趋势;部分I型、II型FaMC在果实发育过程中呈现相反的表达模式.[结论]FaMC基因可能在草莓生长过程中发挥重要作用.
- 相关文献
[1]‘芙蓉李’糖转运蛋白家族基因鉴定及表达分析. 姜翠翠,方智振,周丹蓉,林炎娟,叶新福. 2022
[2]不同氮浓度下茶树氮合成关键酶基因的表达分析. LIN Zhenghe,林郑和,ZHONG Qiusheng,钟秋生,CHEN Changsong. 2014
[3]番鸭呼肠孤病毒的鉴定. 胡奇林,陈少莺,林锋强,程晓霞,林天龙,江斌,陈仕龙,程由铨,李怡英,朱小丽. 2004
[4]香蕉Ran家族基因的全基因组分析. 张雅玲,方智振,赖钟雄. 2015
[5]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010
[6]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009
[7]赤芝全基因组SSR位点的筛选及种质资源遗传多样性分析. 徐晓兰,陈体强,兰进,陈向东,朱风丽,陈虎,石林春,陈士林. 2020
[8]光照诱导广叶绣球菌基因组甲基化分析. 肖冬来,马璐,张迪,王宏雨,林衍铨. 2017
[9]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018
[10]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018
[11]鸡肠道大肠杆菌多抗菌株C20耐药性基因的预测和分析. 田容川,黄薇. 2017
[12]基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异. 杨驰,马璐,肖冬来,江晓凌,刘晓瑜,林衍铨. 2021
[13]18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华. 2019
[14]特色农业微生物基因组研究系统的建立. 郑斯平,陈彬,宋亚娜,关雄,郑伟文. 2010
[15]猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析. 修金生,胡崇伟,陈如敬,王斌,李涛,陈秋勇,林群群. 2013
[16]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010
[17]紫芝基因组rDNA序列特征及ITS2二级结构比较. 陈体强,徐晓兰,石林春,应正河,钟礼义. 2023
[18]基于高通量测序的福安刺葡萄基因组初步研究. 陈婷,周平,刘鑫铭,蔡盛华,雷龑. 2017
[19]鹅圆环病毒研究进展. 万春和,黄瑜. 2015
[20]基因Ⅵb亚型半番鸭源新城疫病毒基因组测序及分析. 黄秋芳,孙敏华,陈少莺,吕殿红,董嘉文,尚毅,吴玄光,胡奇林. 2012
作者其他论文 更多>>
-
基于转录组信息的百合SWEET基因家族鉴定及表达特性分析
作者：杨成龙;徐小萍;郑益平;郭文杰;方少忠
关键词：百合;转录组测序;SWEET家族
-
一株满江红内生真菌的分离鉴定及分生孢子发育研究
作者：黄敏敏;陈美珍;陈坚;郑伟文
关键词：满江红;聚多曲霉;分生孢子;自噬;超微结构
-
土壤不同消毒方式对百合根际真菌群落的影响
作者：方少忠;郭文杰;郑益平;张洁;杨成龙;黄永旺;林智敏
关键词：百合;连作障碍;根际微生物;高通量测序
-
东方百合ANS基因的克隆与对拟南芥过表达的表型分析
作者：杨成龙;张洁;方少忠;郑益平;林智敏
关键词：百合（Lilium）;ANS;花青素;功能分析
-
转录组学揭示七叶一枝花在种子休眠解除相关差异基因
作者：方少忠;苏海兰;郑益平;张洁;杨成龙;林智敏
关键词：七叶一枝花;转录组;种子休眠;基因调控
-
满江红内生细菌的培养及其抗生素抗性基因的检测
作者：陈坚;郑益平;陈彬;郑斯平;郑伟文
关键词：满江红;内生菌;抗生素抗性基因;宏基因组
-
草莓抗重茬生物菌剂的研究与应用
作者：彭小彤;郭文杰;朱炳耀
关键词：草莓抗重茬生物菌剂;熏蒸处理;发病率;产品品质
