文献类型: 中文期刊
作者: 钟雅珠 1 ; 马伯军 1 ; 范海阔 2 ; 陈析丰 1 ; 弓淑芳 2 ; 刘蕊 2 ; 窦雅静 2 ; 孙熹微 2 ; 肖勇 2 ;
作者机构: 1.浙江师范大学
2.海南省热带油料生物学重点实验室/中国热带农业科学院椰子研究所
关键词: 椰子;SPL基因家族;生物信息学分析
期刊名称: 中国南方果树
ISSN: 1007-1431
年卷期: 2021 年 001 期
页码: 38-45
收录情况: 北大核心
摘要: Squamosa promoter binding protein like(SPL)基因是植物特有的转录因子,在植物生长发育过程中发挥重要的调节作用。本研究根据已释放的椰子转录组序列信息和水稻SPL基因家族的蛋白序列信息,从椰子转录组中鉴定出24个CnSPL基因,分别命名为CnSPL1~CnSPL24。Pfam分析表明,椰子24个CnSPL基因同样具有拟南芥和水稻中的SBP-box保守结构域。通过聚类分析将24个基因分成6个亚族(G1~G6)。RPKM分析表明,G5亚族的CnSPL1、CnSPL2、CnSPL3和CnSPL4基因在椰子不同组织中均处于高表达水平,而G3亚族中CnSPL5、CnSPL7、CnSPL11和CnSPL13基因在椰子不同组织中则均处于低表达水平。另外,CnSPL家族基因在胚愈伤组织中均有较高表达,说明CnSPL家族很可能参与椰子胚胎愈伤的形成与分化。
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