文献类型： 中文期刊
作者： 郭振华 1 ; 阮海宇 1 ; 李翔 1 ; 张改平 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院动物免疫学重点实验室;河南农业大学牧医工程学院;云南农业大学动物医学院
关键词： 猪流行性腹泻病毒;遗传变异;进化分析
期刊名称： 中国兽医学报
ISSN： 1005-4545
年卷期： 2020 年 01 期
页码： 1-8
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了解河南省引起仔猪腹泻的猪肠道冠状病毒的感染和流行情况,我们对2017年度发生仔猪腹泻的河南省25家养殖场送检的94份仔猪肠道或粪便样品开展了相关检测。结果显示猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhoea virus,PEDV)的样品检出率为68.1%(64/94),猪场阳性率为76.0%(19/25),但未检测到猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)、猪德尔塔冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDcoV)和猪急性腹泻综合征冠状病毒(swine acute diarrhoea syndrome coronavirus,SADS-CoV)。为进一步分析PEDV的遗传变异情况,利用RT-PCR和基因克隆测序技术,我们成功获得了8株PEDV的S1基因片段的核苷酸序列。分子进化树分析显示,我国流行毒株可以分为G1a(疫苗及其衍生株)、G1b(经典毒株)、G2a(2011-2013年变异株)、G2b(2016-2017年变异株)和G2c(重组毒株)5个进化分支,本研究获得的S1基因序列均处于G2b进化分支,且与2016-2017年间的流行毒株遗传距离更近。同源性分析显示,8株分离株彼此之间S1基因片段的核苷酸同源性为97.3%～99.5%,与变异毒株AJ1102的同源性为97.2%～98.0%,而与经典毒株CV777、CH/S的同源性仅为91.0%～92.3%。氨基酸序列比对分析显示,与CV777和CH/S等经典毒株相比,分离株S1基因片段除了多个氨基酸位点发生变异外,在~(58)NQGV~(61)、~(140)N、~(157)H这3个位置有氨基酸的插入,在~(163)NI~(164 )有2个氨基酸的缺失,这与之前关于PEDV变异株的研究报道相一致。此外,与其他变异株相比,本研究发现分离株HeNPDS/2017在491位有1个新的丝氨酸(Ser)缺失位点,其生物学意义有待进一步研究。本研究丰富了PEDV的分子流行病学数据,有助于了解河南省PEDV流行和遗传变异的最新情况,为该地区猪流行性腹泻病的防控提供一定的参考。
- 相关文献
[1]猪流行性腹泻病毒S2基因的克隆与遗传进化分析. 焦文强,邢广旭,刘运超,徐引弟,王治方,王克领,李海利. 2020
[2]大豆KUP/HAK/KT钾转运体基因家族的鉴定与表达分析. 晁毛妮,温青玉,张晋玉,张志勇,董洁. 2017
[3]河南土鸡群马立克病病毒流行毒株的分离鉴定及分子进化分析. 马圣明,滕蔓,李会珍,党露,宋丽娜,郅玉宝,邓瑞广,罗俊. 2018
[4]河南鸡群马立克氏病病毒流行毒株的分子进化分析. 宿靖伟,罗俊,王新卫,迟佳琦,禹乐乐,党露,赵朴,滕蔓,张改平. 2015
[5]河南省及周边地区猪圆环病毒2型分子流行病学调查. 焦文强,王治方,王克领,白献晓,郎利敏,李海利,朱文豪,张青娴,徐引弟. 2017
[6]抗猪流行性腹泻病毒制剂研究进展. 王艳丰,张丁华,朱金凤,常洪涛,张战军,陈付梅. 2019
[7]猪流行性腹泻病毒部分非结构蛋白真核表达载体的构建与表达. 焦文强,邢广旭,刘运超,徐引弟,王治方,王克领. 2020
[8]2014-2018年猪流行性腹泻病毒N基因遗传变化分析. 邢广旭,焦文强,刘运超,王治方,王克领,徐引弟,李海利,张改平. 2019
[9]猪流行性腹泻病毒与新发腹泻病毒混合感染分析. 焦文强,邢广旭,徐引弟,王丽,王治方,王克领. 2021
[10]猪流行性腹泻病毒RT-PCR方法的建立与应用. 徐引弟,白献晓,李海利,张青娴,朱文豪,王克领. 2016
[11]猪IFN-α14的表达、纯化及抗病毒活性分析. 方剑玉,白杰,席燕燕,黄慧敏,徐引弟,王改利,张青娴,徐彬,李绍钰,王克领. 2022
[12]猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法的建立. 李海利,徐引弟,焦文强,朱文豪,王克领,徐照学. 2015
[13]PEDV、TGEV、RV多重RT-PCR检测方法的建立与应用. 徐引弟,张青娴,李建林,张彬,王克领,朱文豪. 2014
[14]猪流行性腹泻病毒S1蛋白的免疫原性评估. 陈维聪,刘运超,周川杰,杨苏珍,魏蔷,柴书军,张改平. 2022
[15]猪流行性腹泻病毒E蛋白诱发细胞未折叠反应的分子机制. 邢广旭,焦文强,王方雨,张改平. 2022
[16]猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全基因组序列测定与分析. 焦文强,许峰,徐引弟,王治方,张青娴,王克领,朱文豪,李海利,张立宪,郎利敏. 2019
[17]仔猪回肠绒毛M细胞的形态、分布及其与猪流行性腹泻病毒感染的关系. 李任峰,田香勤,乔松林,郭军庆,周恩民,张改平. 2016
[18]猪流行性腹泻病毒RT-PCR方法的建立与应用. 徐引弟,郭成留,梁跃,苏运芳,王克领,朱文豪. 2013
[19]猪肺炎支原体HNMhy1株免疫原性基因的鉴定与分析. 徐引弟,张青娴,王治方,焦文强,李海利,朱文豪,王克领. 2020
[20]1株类NADC30与类JXA1重组的猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组遗传特征分析. 郭振华,阮海宇,耿瑞,陈鑫鑫,乔松林,邓瑞广,张改平. 2020
作者其他论文 更多>>
-
猪细小病毒4型单克隆抗体制备及抗原表位鉴定
作者：柴书军;杨苏珍;刘运超;冯华;魏蔷;王方雨;金前跃;张改平
关键词：猪细小病毒4型;单克隆抗体;抗原表位
-
农业科技创新存在的问题与解决路径
作者：孟凡;李国领;郭振华;张志杰;王亚秋
关键词：乡村振兴;农业科技创新;河南省;农业农村现代化
-
猪繁殖与呼吸综合征病毒入侵宿主细胞途径研究进展
作者：李睿;乔松林;张改平
关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）;入侵;内吞;巨胞饮;膜融合
-
不同绿肥掩青下增施有机肥对烤烟及土壤性状的影响
作者：程培军;李翔;唐培培;张翔;李亮;司贤宗;索炎炎;徐凤丹;李倩
关键词：绿肥掩青;有机肥;硝基腐殖酸;烤烟;产量;产值;土壤性状
-
鸡减蛋综合征病毒中和性单克隆抗体的制备、鉴定及在双抗体夹心ELISA中的应用
作者：魏蔷;李青梅;金前跃;宋亚鹏;白怡霖;张改平
关键词：减蛋综合征病毒;纤维蛋白;中和性单克隆抗体;抗体中和效价;双抗体夹心ELISA
-
农业科技创新存在的问题与解决路径——以实施乡村振兴战略背景下的河南省为例
作者：孟凡;李国领;郭振华;张志杰;王亚秋
关键词：乡村振兴;农业科技创新;河南省;农业农村现代化
-
减蛋综合征病毒抗体胶体金免疫层析试纸条的研制及初步应用
作者：宋亚鹏;孙亚宁;刘琳;杨继飞;李新生;魏蔷;张改平
关键词：减蛋综合征病毒;Fiber蛋白;免疫层析试纸;血凝抑制试验
