您好，欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库！
中国热带农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

猴面花miRNA及靶基因的生物信息学预测

文献类型： 中文期刊

作者： 李崇奇 1 ; 沈文涛 2 ; 言普 2 ; 黎小瑛 2 ; 周鹏 1 ;

作者机构： 1.海南大学

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 猴面花;miRNA;基因组序列;转录因子

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2015 年 01 期

页码： 8-12+15

收录情况： 北大核心

摘要： 以猴面花基因组序列为试材,通过psRobot网站进行茎环结构预测,应用blast-2.2.27+软件与rfam数据库和pfam数据库比对后去除非miRNA序列,应用bioedit分析miRNA序列及前体序列的碱基组成特点。结果表明:猴面花基因组中共发现105条成熟miRNA序列,分别属于49个不同miRNA家族;miRNA序列和其侧翼序列都存在碱基偏倚现象,miRNA5′端第1碱基和第19碱基尿嘧啶和胞嘧啶出现的频率分别为67.6%和49.5%;93个miRNA预测到了靶基因,其中有64个靶向转录因子。

  • 相关文献

[1]巨桉miRNA及其靶基因生物信息学预测. 李崇奇,沈文涛,言普,黎小瑛,周鹏. 2014

[2]基于GSS序列的猴面花miRNA生物信息学研究. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014

[3]香蕉腺苷酸核糖基化作用因子1(MaArf1)基因的克隆及序列结构分析. 王园,王甲水,张建斌,徐碧玉. 2010

[4]5种桉属植物的miRNA生物信息学预测. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014

[5]运用新方法鉴定木薯抗旱相关miRNA表达差异. 杨蕊菊,曾长英,陈新,宋顺,王斌,卢诚,彭明. 2012

[6]拟南芥中与植物生长和耐寒相关的miRNA表达载体的构建. 蔡杰,杨成龙,段瑞军,郭建春. 2010

[7]应用微孔板芯片分析机采血小板常温保存过程中凋亡相关miRNA的表达改变. 陈倩,李朝红,谭琳,张志亮,唐秋萍,许开宁,符策瑛. 2017

[8]香蕉枯萎病菌Dicer-like基因的功能分析. 张欣,漆艳香,曾凡云,王艳玮,谢培兰,谢艺贤,彭军. 2023

[9]基于EST和GSS序列的木豆miRNA生物信息学分析. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014

[10]3个植物保守miRNAs响应香蕉不同品种的抗枯萎病特性表达分析. 宋顺,黄东梅,李艳霞,许桓瑜,许奕. 2015

[11]基于EST和GSS序列的巨桉miRNA研究. 李崇奇,沈文涛,言普,黎小瑛,周鹏. 2014

[12]木薯中开花相关miRNA对phasiRNA的调控. 丛汉卿,龙娅丽,王荣香,孙化鹏,乔飞. 2019

[13]作物抗逆相关miRNA的研究进展. 宋顺,黄东梅,王安邦,孙威,许桂莺,许奕. 2018

[14]利用Solexa测序技术发掘木薯microRNAs. 张何芳,陈新,卢诚,章伟雄,王文泉. 2012

[15]二倍体西瓜及其同源四倍体叶片sRNA表达谱分析. 龙娅丽,江雪飞,周鹏,徐子健,孙梦利. 2018

[16]木薯抗旱相关miRNA表达差异分析. 宋顺,曾长英,薄维平,卢诚,王茜,王文泉. 2010

[17]木薯耐寒相关microRNA的差异表达分析. 薄维平,曾长英,宋顺,周玉飞,王文泉. 2010

[18]基于PCR技术的miRNA定量检测方法. 陈新,曾长英,卢诚,王文泉. 2010

[19]Identification of novel microRNAs in Hevea brasiliensis and computational prediction of their targets. Gebelin, Virginie,Argout, Xavier,Engchuan, Worrawat,Pitollat, Bertrand,Duan, Cuifang,Montoro, Pascal,Leclercq, Julie,Engchuan, Worrawat,Duan, Cuifang. 2012

[20]The small RNA profile in latex from Hevea brasiliensis trees is affected by tapping panel dryness. Gebelin, Virginie,Leclercq, Julie,Argout, Xavier,Sarah, Gautier,Montoro, Pascal,Kuswanhadi,Chaidamsari, Tetty,Hu, Songnian,Yang, Meng,Tang, Chaorong. 2013

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国热带农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台