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利用水稻抗旱种质研究驯化和育种对遗传多样性的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 卫海滨 1 ; 夏辉 1 ; 楼巧君 1 ; 冯芳君 1 ; 马孝松 1 ; 梅捍卫 1 ; 罗利军 1 ;

作者机构： 1.上海市农业生物基因中心

关键词： 水稻;遗传多样性;抗旱性;育种;单核苷酸多态性

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2016 年 32 卷 04 期

页码： 1-5

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用高通量测序获取SNP标记技术对上海市农业生物基因中心99个水稻抗旱种质进行全基因组重测序,分析其遗传多样性和遗传基础。结果表明:在所有SNPs位点中,多态性比率为68.98%(1 927 238/2 793 702),SNPs标记密度在12条染色体上分布范围为4.5—6.2个SNP/kb;供试品种间的遗传距离分布具有两个密度高峰;邻接法构建系统发育树将99个品种划分为籼稻和粳稻两个类群。综合SNPs和进化分析结果表明:水稻在自然选择和人工驯化过程形成复杂进化史,99个抗旱种质在DNA水平上的差异呈现两个极端,遗传距离分布范围较大(0.003—0.998),具有较宽遗传基础和丰富的遗传多样性。本研究以期为水稻节水抗旱新品种选育的亲本选配提供理论依据。

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