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基于BSA-seq技术定位调控西瓜红色果肉形成基因

文献类型: 中文期刊

作者: 张曼 1 ; 王莹莹 1 ; 刘金秋 1 ; 娄丽娜 1 ; 徐建 1 ; 羊杏平 1 ; 徐锦华 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院蔬菜研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室

关键词: 西瓜;果肉颜色;基因定位

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2025 年 41 卷 005 期

页码: 952-959

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 果肉颜色是决定西瓜果实品质的重要性状。本研究以粉色果肉西瓜MW119和红色果肉西瓜MW120为亲本构建F2分离群体,从分离群体中选取红色果肉表型个体和粉色果肉表型个体分别构建子代混池,采用BSA-seq技术对亲本池和子代池进行覆盖深度为30×的全基因组重测序。通过△(SNP-index)法,在2号、4号、5号、6号、7号、9号和10号染色体上鉴定得到12个与红色果肉性状显著关联的区间,区间总长度为56.66 Mb。进一步对显著关联区间内116个携带非同义突变SNP和InDel移码突变的基因进行功能注释和表达分析,最终筛选出5个关键候选基因:WRKY转录因子基因Cla97C02G028430、邻甲基转移酶基因Cla97C02G028680、F-box蛋白基因Cla97C02G048400和Cla97C06G122530,以及三角状五肽重复蛋白基因Cla97C06G122120。这些基因在调控西瓜红色果肉形成中发挥重要作用。本研究结果进一步完善了西瓜红色果肉形成的分子机制,并为分子标记辅助育种提供了理论依据。

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