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利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b基因座位在细胞核内空间组织的研究

文献类型: 中文期刊

作者: 任立成 1 ; 李美英 2 ; 孙元田 1 ; 苏振宇 1 ; 杨智 3 ;

作者机构: 1.海南医学院生物学教研室

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

3.海南医学院形态学实验室

关键词: 环形染色体构象捕获技术;染色体构象捕获技术;Bcl11b基因座位;染色质空间组织

期刊名称: 中国细胞生物学学报

ISSN: 1674-7666

年卷期: 2013 年 11 期

页码: 1584-1591

收录情况: CSCD

摘要: 环形染色体构象捕获(4C)技术实现了在全基因组范围内捕获与4C靶位点发生相互作用的基因座位,因而通过4C相关技术可以进一步研究靶基因座位在细胞核内的空间组织形式。该文以Bcl11b基因座位作为4C分析的靶位点,通过优化4C分析的反向巢式PCR扩增条件,实现4C分析PCR的高效扩增;并通过有限克隆筛选与普通测序分析相结合的方法,在全基因组范围内捕获到一些与Bcl11b基因座位发生潜在相互作用的基因座位。这些基因座位与靶位点间的相互作用既有发生在相同染色体内的,也有发生在不同染色体之间的。这些基因座位间的相互作用表明了Bcl11b基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式。

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