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广东雷州杂草稻sh4和qSH1基因的功能SNP位点序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 夏启玉 1 ; 曹扬 1 ; 孔华 1 ; 李美英 1 ; 张丽丽 1 ; 贺萍萍 1 ; 张雨良 1 ; 郭安平 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室/海南省南繁生物安全与分子育种重点实验室

关键词： 杂草稻;落粒性;sh4;qSH1;序列分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 104-109

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： sh4和qSH1基因是水稻的主效落粒基因,本研究旨在测定雷州杂草稻的sh4和qSH1的基因型,为雷州杂草稻的落粒机制研究提供分子基础。本研究从雷州10个杂草稻群体采集了100个单株及10份栽培稻种子,观测其颖壳颜色、果皮颜色和芒及落粒率,并对sh4和qSH1的功能SNP位点进行PCR扩增及序列分析。结果表明,57份杂草稻的sh4功能SNP位点为野生落粒型(G),15份为杂合型G/T,28份为突变难落粒型(T)。其中,G型和G/T型的72份杂草稻的落粒率都极高(95%～100%),而28份T型杂草稻中,19份为中度落粒(30%～75%),5份杂草稻的落粒率很高(>95%),4份杂草稻的落粒率小于30%。100份杂草稻和10份栽培稻的qSH1功能SNP位点均为G。结合落粒表型及基因型,推测sh4是调控雷州杂草稻落粒性的一个主要基因。

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