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甜瓜果实成熟相关基因家族的全基因组鉴定及分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郭呈宇 1 ; 柳俊 1 ; 李园磊 1 ; 安睿 1 ; 李星岩 1 ; 哈斯阿古拉 1 ;

作者机构: 1.内蒙古大学生命科学学院牧草与特色作物生物技术教育部重点实验室;内蒙古农牧业科学院作物育种与栽培研究所

关键词: 甜瓜;乙烯;果实成熟;乙烯受体;CTR

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2019 年 02 期

页码: 35-43

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为获得与甜瓜果实成熟相关的基因,选择与乙烯生物合成及信号转导相关的4个基因家族HB(Homeobox)、RIN(Ripening inhibitor)、ETR(Ethylene receptor)、CTR(Constitutive triple reaction),对甜瓜全基因组鉴定,分别获得CmHB家族成员17个、CmRIN家族成员21个、CmETR家族成员3个和CmCTR家族成员20个,通过序列比对和基序分析验证了家族成员鉴定的可靠性。利用转录组测序方法,分析4个基因家族各成员在甜瓜品种河套蜜瓜原种和转反义CmACO1基因的河套蜜瓜品系M9生长期和成熟期果实中的表达量,发现河套蜜瓜原种中13个基因在2个发育时期果实中的表达量存在显著性差异,其中CmHB3、CmHB11生长期的表达量是成熟期的42,9倍,而CmHB4成熟期的表达量是生长期的27倍,其表达量均呈极显著差异。在M9品系中,12个基因在2个发育时期果实中的表达量存在显著差异,其中CmHB3、CmHB11生长期的表达量是成熟期的6,3倍,而CmHB4成熟期的表达量是生长期的41倍,其表达量均呈极显著差异。在生长期,CmHB3、CmHB11的表达量在2个材料中存在极显著差异,CmRIN14、CmRIN15存在显著差异。而在成熟期,CmHB3的表达量在2个材料中存在极显著差异,CmRIN14、CmRIN15存在显著差异。此外,还发现CmRIN14、CmRIN15在2个材料间的表达模式相反,表明其表达模式受CmACO1表达水平的影响。

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