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水稻基因组上一个Ds切离及其双位点插入行为的分子鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 赵丁丁 1 ; 乔中英 2 ; 程孝 1 ; 王建平 2 ; 焦翠翠 1 ; 孙丙耀 1 ;

作者机构: 1.苏州大学基础医学与生物科学学院

2.苏州市农业科学院作物研究室

关键词: 水稻;Ds元件;侧翼序列;切离足迹;转座

期刊名称: 遗传

ISSN: 0253-9772

年卷期: 2014 年 36 卷 12 期

页码: 1249-1255

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 玉米转座元件Ac/Ds是h AT转座子家族的成员,导入水稻基因组后具有转座活性,尽管转座机制还不完全清楚,但它们通常经保守的非复制型"剪切-粘贴"过程转座。研究表明,在Ac编码的转座酶作用下,Ds从原位点切离后常优先重新插入到连锁位点。文章利用TAIL-PCR技术从水稻一个Ds插入突变体及其回复突变体中分离Ds侧翼序列,结合生物信息学分析方法,对Ds在突变体上插入位点、回复突变体内切离足迹和重新插入位点进行了分子鉴定。结果显示,突变体中Ds从3号染色体切离后,在原插入位点残留了8 bp足迹序列(CATCATGA),引起Ds标记基因外显子和内含子数目增加,从而影响基因结构。切离后的Ds重新插入回复突变体第2和第6号染色体上,分别编码烟草胺氨基转移酶和衰老相关蛋白的2个基因的编码区。因此,典型的"剪切-粘贴"机制不能完全解释Ds的转座行为,Ds转座存在"剪切-复制-粘贴"的特点。

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