文献类型： 中文期刊
作者： 郑乾明 1 ; 王壮 1 ; 彭志军 1 ; 马玉华 1 ; 蔡永强 1 ;
作者机构： 1.贵州省果树科学研究所
关键词： 仙人掌科;基因组;核苷酸;序列一致性
期刊名称： 植物病理学报
ISSN： 0412-0914
年卷期： 2017 年 47 卷 03 期
页码： 364-369
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 对疑似感染病毒的火龙果(Hylocereus undatus Britt.)进行高通量测序,分析病毒种类和相对含量,为火龙果病毒诊断和检测提供理论基础。测序reads经拼接和注释,共3 969条contig注释为病毒,包含44 354 147条reads。10条contig注释为CVX-NTU(JF937699),其含有的reads占所有病毒reads数量的85.18%;10条contig注释为ZyVX(AY366208),占所有病毒reads数量的4.97%;6条contig注释为SchVX(AY366207),占所有病毒reads数量的3.75%;6条contig注释为CVX(AF308158),占所有病毒reads数量的0.26%。拼接获得的CVX-NTU序列完全覆盖CVX-NTU(JF937699)基因组,核苷酸序列一致性为97%。编码的5个ORF核苷酸序列与CVX-NTU(JF937699)一致性为97%~98%,氨基酸序列一致性为97%~99%。拼接获得的CVX-NTU序列与CVX、ZyVX和SchVX的核苷酸序列一致性分别为78%、75%和70%。这是首次利用高通量测序检测火龙果病毒的报道。
- 相关文献
[1]侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析. 郑乾明,王小柯,王壮,马玉华. 2019
[2]侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析. 郑乾明,柏自琴,王小柯,林乾,王彬,马玉华. 2022
[3]侵染贵州火龙果的蟹爪兰X病毒和火龙果X病毒基因组序列差异和遗传变异. 郑乾明,王小柯,马玉华. 2022
[4]CTAB法提取火龙果基因组DNA的试验研究. 韦茜,蔡永强,金吉芬,陶刚,朱英. 2008
[5]牛病毒性腹泻-黏膜病核酸疫苗的研究现状. 姜玲玲,周思旋,徐洪忠. 2015
[6]紫果西番莲基因组调查及SSR特征分析. 严佳文,解璞,袁启凤,马玉华,廖仕琴. 2020
[7]大粒香基因组重测序分析. 龙武华,刘毅,姜雪,李祖军,吴娴,朱速松. 2024
[8]薏苡黑粉菌基因组测序揭示其物种分类及适应性进化. 李祥栋,郑传奇,陆秀娟,潘虹,魏心元,石明,付瑜华,陆平,高爱农,周美亮. 2022
[9]赤水金钗石斛"鱼肚兰"的基因组特征. 史雪叶,王维泽,杜致辉,晋宇轩,陈之林,付少彬. 2024
作者其他论文 更多>>
-
红肉火龙果α-淀粉酶基因HpAMY3的克隆及功能鉴定
作者：郑乾明;王红林;王小柯;解璞;马玉华
关键词：红肉火龙果;α-淀粉酶;果实发育;亚细胞定位;酵母表达;酶活
-
贵州地方李资源现状及发展建议
作者：赵凯;王红林;郑乾明;解璞;赵晓珍;马玉华
关键词：李;种质资源;分布;类型;开发利用;现状;贵州
-
红肉火龙果HpHXK基因克隆、表达及酶学特性分析
作者：晏霜;解璞;王红林;郑乾明
关键词：火龙果;HXK基因;表达特征;酶学特性;载体构建
-
蜂糖李授粉品种初步筛选
作者：张敏;彭志军;赵雅楠;马玉华
关键词：蜂糖李;授粉品种;坐果率
-
1-甲基环丙烯对不同成熟度蜂糖李货架品质及挥发性物质影响的研究
作者：田一鸣;王瑞;马超;马玉华;李江阔;吉宁;雷霁卿;周集豪
关键词：蜂糖李;采收成熟度;1-甲基环丙烯;货架品质;挥发性物质
-
蜂糖李种质鉴定中孢粉学与InDel标记的应用
作者：解为玮;徐丹彤;陈方策;宋贞富;钟思玲;敖艳飞;安星;王红林;何业华;郑乾明;刘朝阳
关键词：蜂糖李;孢粉学;InDel;分子标记;种质鉴定
-
蜂糖李花芽分化过程与开花特性研究
作者：解为玮;钟乙中;钟思玲;安星;敖艳飞;肖冬娜;罗健东;彭泽;何业华;郑乾明;宋贞富;刘朝阳
关键词：蜂糖李;低产;花芽分化;花原基;双雌蕊
