您好,欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库!

尘螨变应原Der fl全序列的原核表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 崔玉宝 1 ; 周鹏; 彭明; 彭江龙; 周鹰;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词: 尘螨;Der;fl;原核表达;生物信息学

期刊名称: 四川动物

ISSN: 1000-7083

年卷期: 2008 年 000 卷 001 期

页码: 37-43

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的 构建尘螨变应原Der fl原核表达体系,并了解其分子特征.方法 提取粉尘螨总RNA,用RT―PCR合成Der fl编码基因,将其克隆至pMD19-T载体,亚克隆至表达载体pET-28a(+),转化至大肠杆菌并刚IPTG诱导表达.用生物信息学软件对测序结果进行分析并预测其空间结构.结果从粉尘螨总RNA中扩增获得Der fl cDNA片段,成功构建了表达质粒pET-28a(+)-Der fl,Western blotting显示原核表达获得成功.测序结果提交GenBank,臀陆号为EU095368,该基因长966bp,与参考序列同源性达99.9%,推测其编码氩基酸321个,属疏水蛋白,位于细胞外,信号肽位于1~18氨基酸处.同源性分析提示Der fl和Eur ml相似率为88%,而Der fl和Derpl的相似率为77%,分子进化树中粉尘螨和梅氏嗜霉螨聚成一簇.Derfl的二级结构由α-螺旋(109aa,33.96%)、延伸链(55aa,17.13%)、β-转角(18aa,5.61%)和随机卷曲(139aa,43.30%)组成:结论 尘螨变麻原Der fl原核表达获得成功,为进一步生产重组变麻原奠定了基础.生物信息学分析表明粉尘螨和梅氏嗜霉螨的亲缘关系可能更近,而与屋尘螨关系稍远,此与现行的形态学分类系统并不符合.

  • 相关文献

[1]尘螨变应原Der f1全序列的原核表达及生物信息学分析. 崔玉宝,周鹏,彭明,彭江龙,周鹰. 2008

[2]香蕉MaASR1基因的生物信息学分析及原核表达. 张丽丽,徐碧玉,刘菊华,贾彩红,张建斌,金志强. 2017

[3]植物DNA甲基转移酶的生物信息学分析. 吴春太,李维国,高新生,张晓飞. 2010

[4]人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析. 齐兴柱,胡文婷,张俊芳,黄俊生,李军. 2010

[5]菠萝VOZ转录因子序列特征及其对非生物胁迫的响应. 夏杨,苏初连,晁骏,康浩,蒲金基,张贺. 2018

[6]菠萝AcoLFY1转录因子对非生物胁迫的应答响应. 晁骏,康浩,夏杨,苏初连,蒲金基,张贺. 2018

[7]小麦逆境胁迫相关基因TaCBL7的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,郑科,刘泽厚. 2013

[8]小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析. 黄鑫,夏百成,龙翔宇. 2016

[9]椰子蜡质合成相关基因的生物信息学及其表达分析. 朱聪,王富有,孙熹微,王永,张大鹏,石鹏,肖勇. 2022

[10]木薯FRK1类似基因的分离及表达分析. 吴金山,陆小静,王思琦,黄家权,张逸杰,贾迎雪,陈银华. 2023

[11]西红柿(Solanum lycopersicum)潜在内源性致敏蛋白的生物信息学筛选与分析. 黄静,贾瑞宗,朱方超,徐林,郭运玲,郭安平. 2017

[12]麻疯树叶绿体ω-3脂肪酸去饱和酶的BIBAC文库筛选及其生物信息学分析. 付瑜华,夏志强,王海燕,王文泉. 2012

[13]香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析. 王安邦,吴琼,舒海燕,许桂莺,苗红霞,柯建浩,贾彩虹,邢文婷,许奕. 2016

[14]芒果细菌性黑斑病菌XcmR基因的克隆与序列分析. 漆艳香,蒲金基,张欣,陆英,张贺,张辉强,谢艺贤. 2011

[15]油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析. 杨蒙迪,金龙飞,周丽霞,窦雅静,曹红星,李新国. 2021

[16]基于GSS序列的猴面花miRNA生物信息学研究. 李崇奇,周鹏,蔡望伟. 2014

[17]杧果MiNPR1抗病基因克隆及生物信息学分析. 陈思宇,詹儒林,姜成东,柳凤,张国辉,姚全胜. 2023

[18]14-3-3蛋白结构与功能预测及其在木薯成熟期的表达分析. 潘冉冉,秦于玲,乔景娟,赖杭桂,陈松笔. 2018

[19]小麦胁迫相关基因TaLEA2的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,杨丽娟,郑科,刘泽厚. 2014

[20]油棕EgGRF转录因子家族的全基因组鉴定与表达分析. 金龙飞,尹欣幸,曹红星. 2021

作者其他论文 更多>>