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猪丹毒杆菌SpaA基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 卢琴 1 ; 李明波 1 ; 彭先文 1 ; 宋忠旭 1 ; 雷彬 1 ; 梅书棋 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室

关键词： 猪丹毒;PCR检测;SpaA;生物信息学分析

期刊名称： 动物医学进展

ISSN： 1007-5038

年卷期： 2015 年 36 卷 09 期

页码： 23-27

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在对猪丹毒杆菌的SpaA基因进行PCR检测,并对该基因所编码的氨基酸序列进行生物信息学分析。首先对猪丹毒杆菌SpaA基因进行PCR检测,后将SpaA基因的保守区域进行生物信息学分析。结果表明,PCR扩增得到了与猪丹毒杆菌SpaA基因大小一致的1 531bp片段,二级结构的预测结果显示,该蛋白主要以螺旋、无规则卷曲为主,只有少数的伸展链。推测该蛋白有4个B细胞抗原表位区域。该研究为猪场猪丹毒杆菌病的检测提供了试验数据,也为阐明猪丹毒杆菌病的免疫机理和制备表位疫苗等奠定理论基础。

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