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巴西橡胶NBS-LRR抗病基因类似物多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 游启孙 1 ; 莫廷辉 1 ; 曾丽星 2 ; 张影波 3 ; 解辉 1 ; 欧阳超 1 ;

作者机构: 1.海南大学农学院

2.海南大学环境与植物保护学院

3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词: 巴西橡胶;水杨酸;NBS-LRR;抗病基因同源序列(RGAs);核苷酸结合位点(NBS)

期刊名称: 南方农业学报

ISSN: 2095-1191

年卷期: 2013 年 44 卷 03 期

页码: 371-376

收录情况: CSCD

摘要: 【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础。【方法】根据已知抗病基因(Resistancegene,Rgene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48h的巴西橡胶叶片,进行cDNA同源序列克隆。【结果】序列分析结果表明,克隆获得的RGAs经系统进化分析分为TIR-NBS-LRR和non-TIR-NBS-LRR两种类型和9个基因家族;多重比较发现,克隆获得的RGAs具有典型的NBS类抗病基因保守结构域,在与已知植物NBS类序列相似性比较中,与I2c-2基因相似性最高,为46.2%,而巴西橡胶NBS类RGAs之间氨基酸相似性为22.1%~100.0%。进一步研究发现,核苷酸非同义替换和同义替换的比率小于1,有低水平的重组,表明点突变逐步积累是导致纯化选择的主要力量。【结论】通过SA诱导作用和NBS类抗病基因结合得到的巴西橡胶NBS类RGAs具有广泛的遗传多样性,并与已知抗病基因氨基酸序列具高度相似性,这些RGAs候补序列可能与某抗病基因有密切联系。

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