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椰子种质资源遗传多样性的SSR分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周丽霞 1 ; 曹红星 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所/海南省热带油料作物生物学重点实验室

关键词： 椰子;遗传多样性;SSR;聚类分析;亲缘关系

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2018 年 49 卷 09 期

页码： 1683-1690

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究椰子种质资源的遗传多样性,为椰子育种材料的选择及遗传改良提供理论依据。【方法】从100对SSR引物中筛选出多态性引物,并利用其分析26份椰子种质材料的有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon多态性信息指数(I)、多态信息含量(PIC)、多态性百分率(P)及遗传距离,并基于遗传距离对其进行聚类分析,以明确该椰子种质资源的遗传多样性及亲缘关系。【结果】筛选出的31对多态性SSR引物可扩增105个等位基因,平均每对引物扩增3.4个,各引物P为30.77%～84.62%,平均为63.28%;PIC为0.1596～0.8015,平均为0.4958。26份椰子种质材料中,马哇、小黄椰和越南红椰子的I、H和P均最高,分别为0.5501、0.3711和38.71%,云南-海74的I、H和P最低,分别0.2095、0.1583和19.35%。云南34021与云南34007的遗传距离最小,为0.206,三亚红椰-3与云南34024的遗传距离最大,为1.513。聚类分析结果表明,当遗传距离为0.670时,26份椰子种质被分为两大类,其中马哇和越南高种归为一类,剩余24份椰子种质归为另一类;当遗传距离为0.550时,26份椰子种质被分为四大类,即红矮、越南马可波罗、马哇和越南高种分别自成一类,其余22份归为一类。【结论】26份椰子种质的遗传多态性丰富,物种间亲缘关系较远,可为椰子遗传育种提供亲本材料。

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