文献类型： 中文期刊

作者： 田红丽 ¹ ; 杨扬 ¹ ; 范亚明 ¹ ; 易红梅 ¹ ; 王蕊 ¹ ; 金石桥 ² ; 晋芳 ² ; 张云龙 ¹ ; 刘亚维 ¹ ; 王凤格 ¹ ; 赵久然 ¹ ;

作者机构： 1.北京市农林科学院玉米研究所/农业农村部农作物DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建)/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室

2.全国农业技术推广服务中心

关键词： 玉米品种;真实性鉴定;SNP位点集;高鉴别力

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 1115-1123

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 品种真实性是种子质量监测的一个重要指标。为建立准确可靠、快速简便、高通量、低成本的玉米品种真实性鉴定技术,本文利用200个核心SNP位点构建的5816个玉米杂交品种, 3274个自交系的指纹数据,基于遗传算法、品种识别率评估确定了一套高鉴别力的核心SNP位点集,包含96个SNP位点。这96个SNPs全部位于基因内区域,相对均匀分布在10对染色体上。采用上述杂交品种和自交系的指纹数据评估显示这96个位点具有较高多态性和品种区分能力,PIC、MAF、DP平均值分别为0.36、0.40、0.60和0.36、0.39、0.48,对杂交品种、自交系的品种识别率达到99.14%和99.24%。两两样品成对比较结果显示,99.99%的品种间差异位点数目≥3个,杂交品种和自交系中96.74%和95.67%的成对比较差异位点数目集中在30～65个和30～60个。基于221个主推杂交品种的40个SSR位点、96个SNP位点的基因型数据分析结果显示,这2组标记集的鉴定结果具有较高的一致性。综上所述,本研究报道了一套具有位点数量最少、区分能力最强,兼容多平台、适于自动化分型等优点的最优核心SNP集。期望位点集将在玉米品种真实性监测、种子质量控制中得到广泛应用,进而维护玉米种子市场秩序、保障育种者权利以及保护农民利益。