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吉林省玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的构建及应用

文献类型： 中文期刊

作者： 张茗起 1 ; 王蕊 1 ; 张春宵 1 ; 孙擘 1 ; 任洁 1 ; 李淑芳 1 ; 王璐 1 ; 朱少喜 1 ; 张江斌 1 ; 施昕晨 1 ; 王海杰 1 ; 张云龙 1 ; 田红丽 1 ; 赵怡锟 1 ; 匡猛 1 ; 王元东 1 ; 易红梅 1 ; 李晓辉 1 ; 王凤格 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院玉米研究所/农业农村部农作物DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建)/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室

关键词： 玉米;种质资源;吉林;SSR;SNP;分子身份证

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2024 年 57 卷 002 期

页码： 236-249,中插1-中插2

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]农作物种质资源具有重要的战略地位.吉林省玉米种质资源库主要存储具有北方春玉米区特色的种质资源.鉴于在传统农作物种质资源管理过程中难以获取真实身份信息的现状,利用分子标记技术构建种质资源分子身份证可以有效鉴定种质资源真实身份,强化种质资源的分类管理.通过深度发掘吉林省玉米种质资源库的优异资源,推动共享利用.[方法]以吉林省玉米种质资源库中的 2 918 份玉米种质资源为研究对象,采用玉米品种鉴定检测标准中推荐的 40 对SSR标记,以及 61 214 个SNP标记来构建其分子身份证.根据获得的分子身份证信息将种质资源划分为核心、同近源、异质和群体等类进行管理,并进一步针对核心种质进行遗传多样性分析.[结果]为 2 918 份种质资源构建了SSR分子身份证,为除异质性种质外的 2 502 份种质资源构建了SNP分子身份证.分别制定了玉米种质资源SSR和SNP分子身份证的建设规范.其中,SSR分子身份证由 40 个SSR位点指纹转化为三位数字和一位字母的编码组合构成,并以二维码形式存储;SNP分子身份证由 61 214 个SNP位点指纹转化为可视化的条形码.根据样品纯合度和指纹特异性等特征,将样品划分为 1 561 份核心类、705 份同近源类、416 份异质类及 236 份群体类种质资源.遗传多样性分析表明,以旅大红骨群、黄改群为代表的国内种质资源是该库的主要种质资源,占全部核心种质资源的 64.38%.[结论]提出了玉米种质资源分子身份证构建流程,为吉林省玉米种质资源库 2 918 份种质资源构建了全部的 SSR 分子身份证和 2 502 份 SNP 分子身份证;建立了核心、同近源、异质、群体四类种质资源筛选方案,实现了种质资源的分类管理.

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