您好,欢迎访问河南省农业科学院 机构知识库!

侵染地黄的瓜类褪绿黄化病毒基因组序列克隆及系统进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 秦艳红 1 ; 文艺 1 ; 刘玉霞 1 ; 高素霞 1 ; 王飞 1 ; 鲁传涛 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业农村部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室

关键词: 地黄;瓜类褪绿黄化病毒;全基因组序列;系统进化分析;外壳蛋白

期刊名称: 植物保护学报

ISSN: 0577-7518

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 359-369

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为地黄脱毒及防控瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV),从河南省温县、武陟县和禹州市3个主产区采集60份具有花叶、黄化和褪绿等典型症状的地黄病叶样品,利用高通量测序技术对混合病样进行测定,利用CCYV-CPF/CPR和CCYV-P22F/P22R引物对60份样品进行反转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测,并利用9对引物对侵染地黄的CCYV全基因组序列进行扩增和克隆,用DNAMAN 6.0软件对CCYV的分子变异进行分析,利用MEGA X 10.0软件构建系统发育树。结果显示,60份地黄病叶样品中检测出了蚕豆萎蔫病毒2(broad bean wilt virus 2,BBWV2)、地黄花叶病毒(Rehmannia mosaic virus,ReMV)、油菜花叶病毒(youcai mosaic virus,YoMV)和CCYV等病毒;在60份样品中,有22份样品中检测到CCYV,检出率为36.7%;21个地黄分离物之间的CP基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为99.3%~100.0%和98.4%~100.0%,与其他分离物之间的CP基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为94.6%~100.0%和96.8%~100.0%,17个地黄分离物之间的P22基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为98.4%~100.0%和96.3%~100.0%,与其他分离物之间的P22基因核苷酸和氨基酸序列一致率分别为96.1%~100.0%和94.1%~100.0%;基于CP和P22基因核苷酸序列的系统发育树结果显示,CCYV不同分离物形成2个分支。CCYV地黄分离物的基因组包含RNA1和RNA2两个组分,全长分别为8 607 nt和8 041 nt,共编码12个蛋白;CCYV地黄分离物基因组高度保守,与其他分离物基因组RNA1和RNA2的核苷酸一致率均为99.7%~100.0%,基于基因组的系统发育树结果显示,CCYV地黄分离物的核苷酸序列与其他寄主上CCYV分离物的核苷酸序列聚为一个分支,而与毛形病毒属Crinivirus的其他病毒分开。

  • 相关文献

[1]地黄脱毒种栽无土繁育技术研究初报. 张德胜,张振臣,王永江,乔奇,秦艳红,田雨婷,朱昆. 2012

[2]不同脱毒处理怀地黄对干旱胁迫的响应特性. 李萌,腊贵晓,张宝,苏秀红,董诚明. 2023

[3]地黄新品种金九(03-2)的选育及栽培要点. 路翠红,赵正伟,王天亮,王飞. 2012

[4]河南省地黄病毒病初步鉴定. 张振臣,张丽芳,乔奇,王永江,靳秀兰. 2004

[5]黄淮产区地黄种质遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建. 李春鑫,张永战,陈国参,杨铁钢,张英涛,李春,董诚明. 2022

[6]地黄资源遗传多样性分析. 高素霞,刘红彦,王飞. 2010

[7]地黄脱毒技术及增产效果. 张振臣,乔奇,靳秀兰,王永江. 2004

[8]地黄叶片遗传转化再生系统的建立. 刘志刚,李明军,张振臣. 2006

[9]地黄不同时期内生促生细菌的筛选及其促生特性分析. 王春艳,腊贵晓,苏秀红,李萌,董诚明. 2022

[10]地黄多糖超声提取工艺优化及其抗氧化活性. 张骆琪,刘苏伟,王飞,刘玉霞,鲁传涛,刘红彦. 2018

[11]四倍体野生种花生A.monticola全基因组SSR的开发与特征分析. 王玉龙,黄冰艳,王思雨,杜培,齐飞艳,房元瑾,孙子淇,郑峥,董文召,张新友. 2019

[12]猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全基因组序列测定与分析. 焦文强,许峰,徐引弟,王治方,张青娴,王克领,朱文豪,李海利,张立宪,郎利敏. 2019

[13]甘薯褪绿矮化病毒外壳蛋白基因的克隆及在大肠杆菌中的表达. 秦艳红,乔奇,张德胜,田雨婷,王爽,王永江,张振臣. 2013

[14]甘薯褪绿斑病毒外壳蛋白的分子变异及其特异抗血清制备. 乔奇,秦艳红,张德胜,田雨婷,王爽,王永江,张振臣. 2014

[15]甘薯乔治亚曲叶病毒中国分离物外壳蛋白基因的分子变异及在大肠杆菌中的表达. 赵晓立,乔奇,王永江,侯爱芹,许君,郑文明,张振臣. 2017

[16]鹅星状病毒感染在河南地区的分子流行病学调查. 金前跃,郭永刚,李俊朋,秦保亮,王寅彪,郭振华,杜永坤,万博,邢广旭,张改平. 2021

[17]猪源乙型脑炎病毒河南分离株的全基因组测序及进化分析. 禹乐乐,滕蔓,罗俊,迟佳琦,余祖华,柴书军,梁晓晓,张改平,王爱萍. 2012

[18]鹅星状病毒XX株的分离鉴定及遗传特征分析. 金前跃,郭永刚,李俊朋,秦保亮,王寅彪,郭振华,王丽,邢广旭,邓瑞广,张改平. 2021

[19]禽腺病毒4型ZZ株的分离鉴定及系统进化分析. 金前跃,王寅彪,柴永笑,卢清侠,李鹏,郭振华,邢广旭,邓瑞广,张改平. 2020

作者其他论文 更多>>