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茄子全基因组SNP标记的开发

文献类型： 中文期刊

作者： 肖熙鸥 1 ; 聂珩 1 ; 林文秋 1 ; 吴彩玉 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

关键词： 茄子;SNP标记;遗传多样性分析;指纹图谱

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2025 年 52 卷 001 期

页码： 88-100

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 茄子（Solanum melongena L.）是中国重要的茄科蔬菜之一，其具有十分丰富的遗传多样性，对茄子种质资源进行精准评价是利用茄子种质资源的基础。利用40份茄子（Solanum melongena L.）种质资源的重测序数据，筛选了268个SNP位点用于五引物扩增受阻突变体系（penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS）-SNP标记的开发，成功获得原创性的120个PARMS-SNP标记。利用这些标记对224份茄子高代自交系进行基因分型，并进一步进行群体结构、PCA主成分分析和遗传树分析。结果表明该224份材料可以分为两个组。同时根据多态性信息含量（polymorphic information content,PIC）值筛选了48个核心PARMS-SNP标记，并且构建了能够将224份材料进行区分的指纹图谱。

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