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基于SLAF-seq技术构建甘蓝型油菜Polima CMS恢复系核心种质

文献类型： 中文期刊

作者： 赵绪涛 1 ; 柳海东 1 ; 李开祥 1 ; 贾永鹏 1 ; 杜德志 1 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院/青海大学/春油菜遗传改良重点实验室/国家油菜改良中心青海分中心/农业农村部春油菜科学观测实验站/青海省春油菜研究开发中心

关键词： 甘蓝型油菜;波里马雄性不育恢复系;SNP分子标记;SLAF标签;核心种质

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2019 年 04 期

页码： 497-506

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为加快选育适应春油菜区的强优势杂交种,构建甘蓝型油菜Polima CMS恢复系核心种质,以118份波里马不育系的恢复系为材料,利用简化基因组测序技术(SLAF-seq),开发SNP标记,分析群体遗传关系,结合Core Hunter软件进行核心种质构建,得到2516个有效SNP标记位点。基于有效SNP标记,对118份资源进行遗传分析,结果显示:恢复系间平均Nei's遗传距离为0.319,含有不同遗传成分的恢复系之间遗传距离较大;118份资源被聚成5类,来源相同的材料大多被分为同一类;获得两个符合要求的核心种质子集,分别包含34份材料和46份材料,分别命名为C30和C40。通过评价这两种核心种质,等位基因覆盖度都达到了99.8%以上,MR(罗杰斯距离)和CE(卡瓦利-爱德华距离)两种遗传距离指数相差不大,且多态性含量达到了0.28,表明构建的甘蓝型油菜恢复系的核心种质可以代表118份资源,符合植物资源核心种质的构建要求。

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