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海南木豆丛枝植原体质粒全序列测定及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李玲婷 1 ; 车海彦 1 ; 曹学仁 1 ; 杨毅 1 ; 罗大全 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

关键词： 木豆丛枝植原体;质粒;序列分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2014 年 35 卷 07 期

页码： 1404-1408

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 提取木豆叶片基因组总DNA,通过克隆,测序木豆丛枝植原体海南株系质粒(pPPWB-Hn)的完整DNA序列,并使用生物信息学软件对该质粒全长序列进行分析。分析结果显示:pPPWB-Hn质粒全长4 218 bp,含有4个开放阅读框,分别编码Rep、dnaG、threonine synthase和未知蛋白。其中,Rep是2次跨膜蛋白,dnaG是单次跨膜蛋白,Rep和dnaG均与质粒自主复制有关。Rep和未知蛋白可能分布在细胞质中,dnaG可能定位到细胞膜上或膜外,Threonine synthase可能定位到线粒体膜上或线粒体内腔。系统进化树显示:pPPWB-Hn与植原体16SrⅡ组的pPNWB(AY270152),pTBBperi(DQ119297)及pTBBcap(DQ119296)处在同一进化分支。

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