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猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全基因组序列测定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 焦文强 1 ; 许峰 1 ; 徐引弟 1 ; 王治方 1 ; 张青娴 1 ; 王克领 1 ; 朱文豪 1 ; 李海利 1 ; 张立宪 1 ; 郎利敏 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所;河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室

关键词: 猪流行性腹泻病毒;CH-He NXX-2017株;全基因组序列

期刊名称: 山西农业科学

ISSN: 1002-2481

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 113-116+120

摘要: 为了解猪流行性腹泻病毒在河南流行毒株全基因组遗传进化水平,应用RT-PCR方法从疑似猪流行性腹泻病毒感染的病料中扩增出全基因组序列,并将PCR产物纯化后连接pMD20-T载体,转化JM109感受态细胞,挑选单克隆进行测序,获得的序列经过DNA STAR中Edit Sequence软件对全基因组序列进行拼接。结果表明,猪流行性腹泻病毒CH-He NXX-2017株全长28 038 nt(除去poly A);进化树分析显示,该毒株与IA1,USA Colorado2013,MN和PC22A等毒株亲缘关系较为接近,与国内外早期分离株如CV777,LZC,DR13等毒株亲缘关系较远。揭示猪流行性腹泻病毒一直处于不断的进化中,需要一直密切监控病毒进化趋势,为临床诊断以及疫苗研发等提供理论参考。

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