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甘薯引进种SSR遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王娇 1 ; 霍恺森 2 ; 赵路宽 1 ; 赵冬兰 1 ; 唐君 1 ; 陈艳丽 2 ; 曹清河 1 ;

作者机构: 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院甘薯所

2.海南大学热带农林学院

关键词: 甘薯引进种;SSR;遗传多样性;群体结构

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2018 年 005 期

页码: 984-997

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过SSR分子标记,对112份甘薯引进种进行了遗传多样性和群体结构分析,并与中国地方种进行了聚类比较分析.研究了中国目前保存最多的甘薯引进种间的遗传多样性和亲缘关系,以及与地方种间的遗传多样性关系.用SSR建立研究材料的0,1数据库,用ntsys-pc 2.10软件计算遗传距离矩阵并导入MEGA 6.06聚类,利用STRUCTURE 2.3.4软件对112份引进种进行群体结构分析,并将112份引进种与58份中国地方种共170份进行聚类分析.结果表明:112份材料的平均遗传距离为0. 552,遗传距离分布在0. 031到0. 949范围之内.使用Neighbor-Joining (NJ)聚类法,在遗传距离为0. 442处将112份材料分成9个类群,其中类群9又在遗传距离为0. 428处,分为3个亚群.亚群ⅨC含有39份材料,该亚群主要来自南美洲,聚类集中,血缘较为单一.通过群体结构分析将112份材料划分成了2个群体,通过对引进种的来源地比较分析,发现来自南美洲与其他地区种质材料分属于2个群体.通过对引进种和地方种共计170份甘薯资源聚类比较分析,发现中国大陆地方种与中国台湾品种间亲缘关系最近,与东南亚、东北亚、南美洲甘薯引进种间亲缘关系较近,与国际马铃薯中心、国际热带农业研究所的材料和世界蔬菜中心的材料亲缘关系较远.

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