您好，欢迎访问中国热带农业科学院 机构知识库！
中国热带农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 沈婕 1 ; 董世满 1 ; 李淑霞 1 ; 彭明 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 木薯;低温胁迫;lncRNA;功能分析;同源性分析;RNA二级结构预测;共表达基因分析;靶基因

期刊名称： 热带作物学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 40-46

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 低温胁迫严重影响木薯的生长、产量以及块根品质。长链非编码RNAs（lncRNAs）作为关键的调节因子,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要的功能。然而,lncRNAs在木薯中的功能和调控机制尚无报道。因此,为了研究木薯lncRNAs在低温胁迫应答中的功能,本研究以木薯主栽品种’60444’为材料,利用低温处理前后的叶片转录组数据,鉴定到一个受低温胁迫调控的lncRNA（cold-responsive lncRNA5,CRR5）。通过对其序列比对进行同源性分析,RNA二级结构预测和共表达分析鉴定来分析lncRNA-CRR5响应低温胁迫的分子功能。并根据基因的共表达分析推测CRR5的顺式作用和反式作用靶基因。这些结果为更进一步研究CRR5的功能提供了理论依据。

  • 相关文献

[1]植物抗逆相关miRNA的研究及其在木薯中的应用. 曾长英,陈新,卢诚,王文泉,彭明. 2010

[2]miR395abcd与其靶基因ATRX在不同耐寒木薯品种中对低温响应的差异性分析. 曾长英,周玉飞,彭明. 2015

[3]一个预测的木薯衰老相关基因的获得及其功能分析. 时涛,李超萍,蔡吉苗,李博勋,黄贵修. 2017

[4]木薯糖转运蛋白MeSWEET18的克隆与功能分析. 薛晶晶,安飞飞,朱文丽,罗秀芹. 2023

[5]木薯枯草杆菌蛋白酶家族鉴定及MeSDD1的功能分析. 肖亮,鲍茹雪,曹升,陆柳英,尚小红,曾文丹,聂宣红,严华兵. 2022

[6]木薯MebZIP2基因克隆及其功能分析. 陈甘露,颜彦,孟宪伟,付莉莉,邱先进,丁泽红,胡伟. 2024

[7]木薯MeUGT85K4基因的克隆和功能分析. 赵平娟,郭鑫,林晨俞,张秀春,王海燕,彭明. 2021

[8]木薯响应低温胁迫差异蛋白质的功能分析及鉴定. 沈婕,李淑霞,彭明. 2019

[9]应用蛋白质印迹技术研究低温胁迫对木薯叶片抗氧化酶的影响. 欧文军,安飞飞,杨龙,李开绵. 2016

[10]木薯苯丙氨酸解氨酶基因的克隆及其对低温胁迫的响应. 吴远航,刘秦,刘攀道,郭鹏飞,李敏,蒋凌雁,罗丽娟. 2019

[11]低温胁迫对木薯叶片叶绿素荧光参数及PSⅡ相关蛋白表达水平的影响. 安飞飞,李庚虎,陈霆,李开绵. 2014

[12]低温胁迫对木薯幼苗叶片转化酶及可溶性糖含量的影响. 姚远,闵义,胡新文,李开绵,郭建春. 2010

[13]钙对低温胁迫下木薯抗寒相关生理指标的影响. 冀乙萌,惠杜娟,李瑞梅,郭建春. 2012

[14]低温胁迫对木薯组培苗叶片若干代谢生理指标的影响. 欧文军,罗秀芹,李开绵. 2015

[15]木薯耐寒种质筛选初报. 周建国,李开绵,叶剑秋,杨鹏雅,王文泉. 2009

[16]木薯SR45亚家族基因鉴定及表达. 李智博,董世满,李淑霞,彭明,曾长英. 2022

[17]木薯MeMYC2.2基因耐低温功能研究. 于晓玲,李文彬,李智博,阮孟斌. 2023

[18]香蕉长链非编码RNA基因MalncPSA的克隆及表达分析. 李文彬,张琪,彭明. 2017

[19]辽宁省辣椒土传病害镰刀菌鉴定及rDNA- ITS序列分析. 张亭亭,刘长远,赵奎华,梁春浩,关天舒,王辉,黄俊生. 2011

[20]香蕉ACC氧化酶基因(MAO3)的克隆及其表达特性分析. 黄俊生,王华,张世清. 2005

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国热带农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台