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玉米株高和穗位高的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 钱甫 1 ; 张占琴 1 ; 陈树宾 1 ; 桑志勤 1 ; 李卫华 1 ;

作者机构： 1.石河子大学农学院/绿洲生态农业兵团重点实验室;新疆农垦科学院

关键词： 玉米;株高;穗位高;全基因组关联分析

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2024 年 32 卷 001 期

页码： 65-73,81

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以580份遗传多样性丰富的玉米自交系为关联群体,利用分布于全基因组的31 826个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)分别对株高和穗位高性状 3 年表型值及 BLUE(Best Linear Unbiased Esti-mate)值进行全基因组关联分析.结果表明,4个环境下共检测到58个显著性SNPs,共定位的SNPs有6个,其中3个与株高显著关联,4个与穗位高显著关联.在共定位显著标记440kb范围内,共检测到76个关联基因,其中66个有基因描述,53个基因在GO(Gene Ontology)富集分析中得到分类,可归类到20类生物过程、10类分子功能以及8类细胞组成.综合基因功能注释和GO富集分析结果,预测了7个可能与株高和穗位高性状有关的候选基因.

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