文献类型： 中文期刊
作者： 邱涛涛 1 ; 苏鸿飞 1 ; 王瑜 1 ; 张禾佳 1 ; 胡慧欣 1 ; 阮诗婷 1 ; 袁星星 1 ; 谢彦杰 1 ;
作者机构： 1.南京农业大学生命科学学院;江苏省农业科学院经济作物研究所
关键词： 绿豆;GPX基因家族;非生物胁迫;基因表达
期刊名称： 南京农业大学学报
ISSN： 1000-2030
年卷期： 2024 年 47 卷 003 期
页码： 453-461
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： [目的]本文利用生物信息学方法从绿豆基因组中筛选谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPX)基因家族成员,并探究其组织表达模式及其对若干胁迫的响应.[方法]利用生物信息学的方法对绿豆GPX家族的等电点、相对分子质量、共线性、上游顺式作用元件等进行分析,通过转录组测序和RT-qPCR进一步分析绿豆GPX基因家族的组织表达模式以及在不同逆境胁迫和激素作用下的表达水平.[结果]从绿豆基因组中筛选出 8 个GPX基因,其不均匀分布于 1/2/3/5/10 号染色体上.基因结构及基序分析结果显示,8 个GPX的基因结构类似,均含有 6 个内含子区域,并且大部分 GPX成员都具有UTR区.转录组以及RT-qPCR分析结果表明,多个GPX家族成员均能响应多种逆境胁迫.组织表达分析结果显示,不同GPX家族成员在不同组织中呈特异性表达;GPX家族整体在绿豆中表达丰度较低,但表达量能被各种胁迫强烈诱导.[结论]绿豆GPX基因家族响应多种非生物胁迫,不同GPX成员响应的胁迫类型不同.
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