您好,欢迎访问甘肃省农业科学院 机构知识库!

芸芥木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶基因EsXTH1的cDNA克隆和生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈姣荣 1 ; 方彦 2 ; 孙万仓 3 ; 令利军 4 ; 姜海杨 5 ;

作者机构: 1.甘肃省干旱生境作物学重点实验室

2.甘肃农业大学研究测试中心

3.甘肃农业大学农学院

4.甘肃省农业科学院

5.甘肃省干旱生境作物学重点实验室河西学院甘肃农业大学测试研究中心

关键词: 芸芥;自交亲和系;木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶;基因克隆;功能预测

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2013 年 35 卷 02 期

页码: 131-136

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解XTH(木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶)基因在芸芥自交亲和系突变体(self-compatibility,SC)和自交不亲和系(self-incompatibility,SI)育性调控中的作用,分别以芸芥野生型SI系和突变体SC为材料,取植株的全花cDNA为模板,采用mRNA差异显示技术(differential display reverse transcription PCR,DDRT-PCR)筛选差异片段,获得了芸芥XTH基因的全长cDNA(EsXTH1,1 074bp)。序列分析表明,EsXTH1的5'端和3'端非翻译区分别为36bp和180bp,包含1个858bp的开放阅读框,编码一条285个氨基酸残基组成的肽链;推导的EsXTH1蛋白序列含有XTH蛋白的活性部位DEIDFEFL;芸芥EsXTH1与其它植物的XTH蛋白具有较高的同源性,与拟南芥At-XTH6同源性最高(89.1%),与拟南芥AtXTH7、番茄SlXTH7及康乃馨DcXTH4的同源性分别为73%、73%及69%。分子进化树分析表明,EsXTH1与AtXTH7、SlXTH7、DcXTH4更近。EsXTH1具有木葡聚糖内糖基转移酶(xyloglucan endotran,XET)和水解酶(xyloglucan endohydrolase,XEH)的功能结构位点,N端有一个由23个氨基酸组成的信号肽。预测认为EsXTH1与蛋白质分泌相关,与芸芥自交亲和性的调控相关。

  • 相关文献

[1]芸芥(Eruca sativa Mill.)与芸薹属(Brassica L.)3个油用种的远缘杂交. 孙万仓,官春云,孟亚雄,刘自刚,张涛,李栒,杨随庄,令利军,陈社元,曾秀存,王鹤龄. 2005

[2]化学药剂处理克服芸芥自交不亲和性效果研究. 孙万仓,刘自刚,孟亚雄,张涛,曾秀存,王鹤林,王保成,邵登魁. 2004

[3]芸芥与白菜型油菜远缘杂交亲和性研究. 张涛,孙万仓. 2004

[4]中国芸芥形态特征特性及类型研究. 孙万仓,官春云,孟亚雄,刘自刚,张涛,张金文,陈社员,范惠玲,王保成,邵登魁,武军艳,燕尼,朱惠霞. 2006

[5]利用RAPD分子标记技术研究芸芥(Eruca Mill.)的遗传多样性. 孙万仓,范惠玲,孟亚雄,张涛,张金文,王保成,武军艳,邵登魁,朱惠霞,燕妮,赵玉昌. 2006

[6]芸芥(Eruca.sativa Mill)总DNA提取方法及RAPD扩增体系研究. 范惠玲,孙万仓,孟亚雄. 2007

[7]我国芸芥的分布区域和品质特性及研究价值. 杨玉萍. 2001

[8]芸芥(Eruca sativa Mill.)对菌核病的抗性研究. 官春云,李方球,李栒,陈社员,刘忠松,王国槐,孙万仓. 2004

[9]芸芥果胶酸裂解酶基因的克隆及序列分析. 方彦,杨刚,孙万仓,武军艳,刘自刚,曾秀存,李学才,董云. 2016

[10]中国芸芥遗传多样性RAPD标记分析. 孙万仓,官春云,张金文,孟亚雄,刘自刚,张涛,李栒,陈社元. 2003

[11]小麦锌指蛋白基因的克隆、序列与表达分析(英文). 万平,令利军,周文娟,张文俊,凌宏清,朱立煌,张相岐. 2004

[12]半夏凝集素基因的克隆与氨基酸序列初步分析. 张正英. 2012

[13]玉米逆境响应基因ZmGST23克隆和表达分析. 李永生,方永丰,李玥,张同祯,慕平,王芳,彭云玲,王威,张金文. 2016

[14]梨小食心虫卵黄原蛋白基因的鉴定及表达分析. 霍楠,胡军,孙江,吕品,王苑馨,杨军,罗进仓,贾栋. 2024

[15]桃Pp4CL2基因的克隆及抗寒功能验证. 李小兰,郝兰兰,张帆,王鸿. 2022

[16]利用BSA-Seq方法快速定位作物农艺性状QTL/基因概述. 周文期,刘忠祥,王晓娟,何海军,周玉乾,杨彦忠,连晓荣,李永生. 2022

[17]灰葡萄孢菌诱导的百合转录辅激活因子LlMBF1a基因的克隆及其特征分析. 曹兴,张秀省,侯栋,隋娟娟,穆红梅,高祥斌,吕福堂,郭尚敬,王桂清. 2018

[18]基因工程改变花卉植物花色的研究. 王玉萍,张峰,支小刚. 2002

[19]小麦锌指蛋白基因的克隆、序列与表达分析. 万平,令利军,周文娟,张文俊,凌宏清,朱立煌,张相岐. 2004

作者其他论文 更多>>