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亚洲棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王园园 1 ; 赵春月 1 ; 孙润润 1 ; 秦腾飞 1 ; 张金宝 1 ; 郑巨云 2 ; 杨秋月 1 ; 翟勇全 1 ; 孙家良 1 ; 王清连 1 ;

作者机构: 1.河南科技学院生命科技学院现代生物育种河南省协同创新中心河南省棉麦分子生态与种质创新重点实验室

2.新疆农业科学院经济作物研究所

关键词: 亚洲棉(Gossypium arboretum L.);核因子Y;基因家族;生物信息学;表达模式

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2021 年 014 期

页码: 4564-4573

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: NF-YA家族基因在植物生长发育过程中发挥重要作用,如调控种子发育和种子萌发,响应干旱和盐胁迫等。本研究利用生物信息学手段从亚洲棉全基因组鉴定NF-YA家族基因,并从理化性质、基因的内含子和外显子结构、氨基酸序列的功能结构域、系统进化发育特征、在染色体的分布和表达模式等方面分析了该家族基因的特征。结果表明:GaNF-YA包含15个成员,分布在9条染色体上,编码蛋白质长度为160~1 079个氨基酸,相对分子质量为17.92~120.30 kD,包含外显子4~6个,为碱性。亚洲棉NF-YA基因可分为三组,且三组NF-YA基因结构存在差异,保守基序分析其均含有A1和A2结构域。通过对启动子顺式作用元件和表达谱分析,推测GaNF-YA基因可能在棉花种子和纤维形成、种子萌发及环境胁迫等中具有重要作用。本研究为进一步解析亚洲棉NF-YA家族基因的功能提供理论依据。

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