文献类型： 中文期刊

作者： 肖蓉 ¹ ; 曹秋芬 ² ; 聂园军 ³ ; 张春芬 ¹ ; 邓舒 ¹ ; 孙海峰 ⁴ ; 李倩 ⁵ ;

作者机构： 1.山西省农业科学院果树研究所

2.山西省农业科学院生物技术研究中心

3.山西省农业科学院农业资源与经济研究所

4.山西大学化学化工学院

5.山西省农业科学院小麦研究所

关键词： 草莓炭疽病;高通量测序;细菌多样性;群落结构

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2017 年 11 期

页码： 14-20

摘要： 研究旨在比较患炭疽病草莓与健康草莓根际土壤细菌群落多样性,了解其细菌群落生态特征,为找到有效的生防菌奠定基础。本研究基于土壤细菌16S r DNA V3-V4区基因多样性,利用Illumina Miseq高通量测序技术进行比较研究。研究得出:与健康对照相比,患病土壤细菌的OTUs数目及多样性指数均较低;在门水平上,变形菌门、拟杆菌门、浮霉菌门等是2种生境共有的优势类群;在属水平上,2种生境的优势菌丰度有差异,患病土壤的假单胞菌属丰度显著降低,气单胞菌属丰度显著升高;而且,健康土壤的解毒类菌、固氮菌、光合菌和硝化菌丰度均高于患病土壤。健康草莓根际土壤细菌丰富度及多样性均高于患病草莓,2种生境细菌菌群结构有差异,且健康土壤中对植物有益的功能微生物群体含量高于患病土壤。